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Enregistrement W3171071751 · doi:10.1038/s41598-021-92090-6

DCBLD1 is associated with the integrin signaling pathway and has prognostic value in non-small cell lung and invasive breast carcinoma

2021· article· en· W3171071751 sur OpenAlexafffund
Guillaume B. Cardin, Monique Bernard, Françis Rodier, Apostolos Christopoulos

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensUniversité du Québec à MontréalUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesCancer Research UK Cambridge Institute, University of CambridgeKungliga Tekniska HögskolanUniversité de MontréalInstitute of Cancer ResearchInstitut Du Cancer de MontréalCancer Research UKFonds de Recherche du Québec - SantéLudwig Institute for Cancer Research
Mots-clésMedicineOncologyInternal medicineAdenocarcinomaBreast carcinomaBreast cancerColorectal cancerCarcinomaCohortCancer researchCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Germline single nucleotide polymorphisms in the promoter region of the DCBLD1 gene are associated with non-smoking cases of both non-small cell lung carcinoma (NSCLC) and human papillomavirus-negative head and neck cancer. However the clinical relevance and function of DCBLD1 remain unclear. This multicenter retrospective study was designed to evaluate the prognostic value and function of DCBLD1 in the four main solid cancers: NSCLC, invasive breast carcinoma, colorectal adenocarcinoma and prostate adenocarcinoma. We included the following cohorts: GSE81089 NSCLC, METABRIC invasive breast carcinoma, GSE14333 colorectal adenocarcinoma, GSE70770 prostate adenocarcinoma and The Cancer Genome Atlas (TCGA) Firehose Legacy cohorts of all four cancers. DCBLD1 gene expression was associated with a worse overall survival in multivariate analyses for both NSCLC cohorts (TCGA: P = 0.03 and GSE81089: P = 0.04) and both invasive breast carcinoma cohorts (TCGA: P = 0.02 and METABRIC: P < 0.001). Patients with high DCBLD1 expression showed an upregulation of the integrin signaling pathway in comparison to those with low DCBLD1 expression in the TCGA NSCLC cohort (FDR = 5.16 × 10 –14 ) and TCGA invasive breast carcinoma cohort (FDR = 1.94 × 10 –05 ).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,198
Score d'incertitude au seuil0,601

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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