DCBLD1 is associated with the integrin signaling pathway and has prognostic value in non-small cell lung and invasive breast carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Germline single nucleotide polymorphisms in the promoter region of the DCBLD1 gene are associated with non-smoking cases of both non-small cell lung carcinoma (NSCLC) and human papillomavirus-negative head and neck cancer. However the clinical relevance and function of DCBLD1 remain unclear. This multicenter retrospective study was designed to evaluate the prognostic value and function of DCBLD1 in the four main solid cancers: NSCLC, invasive breast carcinoma, colorectal adenocarcinoma and prostate adenocarcinoma. We included the following cohorts: GSE81089 NSCLC, METABRIC invasive breast carcinoma, GSE14333 colorectal adenocarcinoma, GSE70770 prostate adenocarcinoma and The Cancer Genome Atlas (TCGA) Firehose Legacy cohorts of all four cancers. DCBLD1 gene expression was associated with a worse overall survival in multivariate analyses for both NSCLC cohorts (TCGA: P = 0.03 and GSE81089: P = 0.04) and both invasive breast carcinoma cohorts (TCGA: P = 0.02 and METABRIC: P < 0.001). Patients with high DCBLD1 expression showed an upregulation of the integrin signaling pathway in comparison to those with low DCBLD1 expression in the TCGA NSCLC cohort (FDR = 5.16 × 10 –14 ) and TCGA invasive breast carcinoma cohort (FDR = 1.94 × 10 –05 ).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».