The enteropathogenic E. coli receptor Tir remains non‐ubiquitylated to enable the bacteria to remain extracellular
Notice bibliographique
Résumé
Cells use clathrin‐mediated endocytosis as one strategy to internalize particles from the extracellular compartment. This mechanism of internalization requires the use of a ligand and receptor for the internalization event to occur. Recent work suggests that in order for large particles to enter non‐phagocytic cells their receptors must become ubiquitylated. Ubiquitylation involves the posttranslational modification of a protein by ubiquitin. Enteropathogenic E. coli (EPEC) is an extracellular microbe that injects its own receptor, called the translocated intimin receptor (Tir), into epithelial cells. Surprisingly clathrin‐associated components are recruited to the site of EPEC/host cell contact, but somehow clathrin's internalization function is blocked. We hypothesized that the EPEC receptor Tir remains non‐ubiquitylated to ensure that EPEC remains extracellular. To test this hypothesis we used immunoprecipitations and western blotting of EPEC infected epithelial cells to examine the ubiquitylation status of EPEC Tir and found that it does not become ubiquitylated. To functionally test our hypothesis we forced EPEC Tir to be ubiquitylated by directly fusing ubiquitin to EPEC Tir. This fusion was transfected into epithelial cells and the cells infected with EPEC containing a non‐functional Tir, resulting in the bacteria being internalized. Our work demonstrates that during normal EPEC infections, the blockage of Tir receptor ubiquitylation contributes to EPEC remaining extracellular.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».