MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3171357627 · doi:10.1101/2020.05.04.076521

Multimodal principal component analysis to identify major features of white matter structure and links to reading

2020· preprint· en· W3171357627 sur OpenAlexafffund
Bryce Geeraert, Maxime Chamberland, R. Marc Lebel, Catherine Lebel

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaWellcome Trust
Mots-clésWhite matterPrincipal component analysisDiffusion MRINeuroscienceFractional anisotropyCorpus callosumArtificial intelligencePsychologyComputer scienceNuclear magnetic resonancePattern recognition (psychology)PhysicsMagnetic resonance imagingMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The role of white matter fibers in reading has been established by diffusion tensor imaging (DTI), but DTI cannot identify specific microstructural features driving these relationships. Neurite orientation dispersion and density imaging (NODDI), inhomogeneous magnetization transfer (ihMT) and multicomponent driven equilibrium single-pulse observation of T1/T2 (mcDESPOT) can be used to link more specific aspects of white matter microstructure and reading due to their sensitivity to axonal packing and fiber coherence (NODDI) and myelin (ihMT and mcDESPOT). We applied principal component analysis (PCA) to combine DTI, NODDI, ihMT and mcDESPOT measures (10 in total), identify major features of white matter structure, and link these features to both reading and age. Analysis was performed for nine reading-related tracts in 46 neurotypical 6-16 year olds. We identified three principal components (PCs) which explained 79.5% of variance in our dataset. PC1 probed tissue complexity, PC2 described myelin and axonal packing, while PC3 was related to axonal diameter. Mixed effects models regressions did not identify any relationships between principal components and reading skill. Further Bayes factor analysis revealed that absence of relationships was not due to low power. PC1 suggested increases in tissue complexity with age in the left arcuate fasciculus, while PC2 suggested increases in myelin and axonal packing with age in the bilateral arcuate, inferior longitudinal, inferior fronto-occipital fasciculi, and splenium. Multimodal white matter imaging and PCA produce microstructurally informative, powerful principal components which can be used by future studies of development and cognition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications→Travaux en français237 207→