Interpretation of repeated testing for Mycobacterium avium subsp paratuberculosis on Ontario dairy herds
Notice bibliographique
Résumé
The Ontario Johne's Education and Management Assistance Program (OJEMAP) is a dairy industry-funded Johne's disease (JD) control program launched in January 2010. The program offers dairy producers a one-time opportunity to test their adult cow herd for antibodies against Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) by use of a milk or blood ELISA test. As herds completed their milking herd test, a common question from herd owners and veterinarians was "When should I test next .... how often should I test my herd?" A review of aggressive JD control programs around the world suggests that there are no standard recommendations regarding testing frequency. The Danish program, in existence for 7 years, is based on quarterly testing of the entire milking herd using a milk ELISA. Dr. Soren Nielsen, who developed the Danish Program and serves as its director, argues that given the relatively poor sensitivity of all JD tests, quarterly testing allows each cow to have at least 3 test results per year, the results of which can then be used to classify cows as at high-, moderate-, or low-risk for transmitting MAP to herd mates. Implementation of this strategy has led to a decrease in JD test-positive prevalence from 10% to 6% of cows in herds participating in the program. Unfortunately, this aggressive herd test program carries a high cost and the benefits of quarterly testing over a single annual test are difficult to quantify. The objective of this project was to evaluate and gain experience in the interpretation of repeated testing for MAP with currently available tests in Ontario dairy herds.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,012 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».