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Enregistrement W3171689681 · doi:10.1093/ecco-jcc/jjab075.016

OP17 Impact of phenotypic and genetic factors on Crohn’s Disease evolution in a cohort of 13,926 patients

2021· article· en· W3171689681 sur OpenAlexaboutno aff
Q Zhang, Laura Fachal, Rasha Shawky, Miles Parkes, Carl A. Anderson, Tim Raine

Notice bibliographique

RevueJournal of Crohn s and Colitis · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineDiseaseCohortInfliximabInternal medicineCrohn's diseaseClinical phenotypeAdalimumabInflammatory bowel diseasePhenotypeOncologyGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Patients with Crohn’s disease (CD) can develop complications including stricturing and penetrating disease [1, 2]. Although reliable baseline predictors of disease progression are urgently needed to inform management strategies, few studies have comprehensively explored the phenotypic and genetic determinants of disease progression in a sufficiently powered cohort. Methods We used data from 13,926 patients with CD in the UK IBD BioResource to investigate the effects of clinical phenotypes and genetics on CD progression. Median follow-up was 10.6 years and total follow-up was 193,033 patient-years. We applied the Montreal classification system to define disease as B1 (inflammatory), B2 (stricturing) and B3 (penetrating). Patients with B2 or B3 disease (N = 5,185) were compared to patients with B1 disease (N = 8,471) in a multivariate model fitted with both phenotype data and a polygenic score that we developed. Associations with q-values (false discovery rate adjusted p-values) less than 0.05 were defined as statistically significant. Results CD progression occurred over time from diagnosis (Figure 1). Consistent with previous findings, we confirmed factors including smoking, disease location and perianal disease were associated with disease progression [3] (Table 1). The impact of a genetic influence on disease progression was confirmed and shown to be independent of genetic effects on disease location [4]. Early prescription of medications showed a protective effect on disease progression: Infliximab, adalimumab and thiopurines significantly reduced the chance of B2/B3 progression when prescribed within two years of diagnosis. Additionally, we observed a decreased progression to B2/B3 disease in patients diagnosed recently (between 2012–2020) compared to those diagnosed before 2012. This finding persisted after conditioning on exposure to biologics and correcting for follow-up time and interval to first thiopurine prescription, and thus may be indicative of other improvements in standards of care in recent years. Conclusion Using a large, well-characterised cohort we confirm the importance of disease location, smoking status and genetics on disease progression. We highlight the positive impact of early medication prescription on disease progression and discover an independent signal relating to potential improvements in the standard of care in CD over time. These results create the framework for reliable predictors of CD progression that may better guide future CD management strategies. References

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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