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Enregistrement W3171814294 · doi:10.3390/app11115150

Metagenomic Discovery and Characterization of Multi-Functional and Monomodular Processive Endoglucanases as Biocatalysts

2021· article· en· W3171814294 sur OpenAlexafffund
Ming Fan, Weijun Wang, Laurence E. Cheng, Jiali Chen, Wenyi Fan, Min Wang

Notice bibliographique

RevueApplied Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaChina Scholarship CouncilAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of GuelphMinistry of Agriculture, Food and Rural AffairsOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsSwine Innovation Porc
Mots-clésCellulaseThermotoga maritimaXylanCelluloseLignocellulosic biomassChemistryCell wallBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biomass includes cellulose, hemicelluloses, pectin and lignin; constitutes the components of dietary fibre of plant and alge origins in animals and humans; and can potentially provide inexhaustible basic monomer compounds for developing sustainable biofuels and biomaterials for the world. Development of efficacious cellulases is the key to unlock the biomass polymer and unleash its potential applications in society. Upon reviewing the current literature of cellulase research, two characterized and/or engineered glycosyl hydrolase family-5 (GH5) cellulases have displayed unique properties of processive endoglucanases, including GH5-tCel5A1 that was engineered and was originally identified via targeted genome sequencing of the extremely thermophilic Thermotoga maritima and GH5-p4818Cel5_2A that was screened out of the porcine hindgut microbial metagenomic expression library. Both GH5-tCel5A1 and GH5-p4818Cel5_2A have been characterized as having small molecular weights with an estimated spherical diameter at or < 4.6 nm; being monomodular without a required carbohydrate-binding domain; and acting as processive β-1,4-endoglucanases. These two unique GH5-tCel5A1 and GH5-p4818Cel5_2A processive endocellulases are active in hydrolyzing natural crystalline and pre-treated cellulosic substrates and have multi-functionality towards several hemicelluloses including β-glucans, xylan, xylogulcans, mannans, galactomannans and glucomannans. Therefore, these two multifunctional and monomodular GH5-tCel5A1 and GH5-p4818Cel5_2A endocellulases already have promising structural and functional properties for further optimization and industrial applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,203

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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