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Enregistrement W3171841570 · doi:10.21203/rs.3.rs-1005999/v1

Hypertrophic Cardiomyopathy Diagnosis Based on Cardiovascular Magnetic Resonance Using Deep Learning Techniques

2021· preprint· en· W3171841570 sur OpenAlexaff
Danial Sharifrazi, Roohallah Alizadehsani, Navid Hoseini Izadi, Mohamad Roshanzamir, Afshin Shoeibi, Fahime Khozeimeh, Fariba Alizadeh Sani, Zahra Alizadeh Sani, Sadiq Hussain, Chandrashekhar Harlapur, J. M. Górriz, Abbas Khosravi, Saeid Nahavandi, Nizal Sarrafzadegan, Sheikh Mohammed Shariful Islam

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypertrophic cardiomyopathyArtificial intelligenceConvolutional neural networkDeep learningMagnetic resonance imagingComputer sciencePattern recognition (psychology)Cardiac magnetic resonanceMedicineRadiologyCardiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) can lead to serious cardiac problems. HCM is often diagnosed by an expert using cardiovascular magnetic resonance (CMR) images obtained from patients. In this research, we aimed to develop a deep learning technique to automate HCM diagnosis. CMR images of 37421 healthy and 21846 HCM patients were obtained during two years. Images obtained from female patients form 53% of the collected dataset. The mean and standard deviation of the dataset patients’ age are 48.2 and 19.5 years, respectively. Three experts inspected images and determined whether a case has HCM or not. New data augmentation was used to generate new images by employing color filtering on the existing ones. To classify the augmented images, we used a deep convolutional neural network (CNN). To the best of our knowledge, this is the first time CNN is used for HCM diagnosis. We designed our CNN from scratch to reach acceptable diagnosis accuracy. Comparing the designed algorithm output with the experts’ opinions, the method could achieve accuracy of 95.23%, recall of 97.90%, and specificity of 93.06% on the original dataset. The same performance metrics for the designed algorithm on the augmented dataset were 98.53%, 98.70%, and 95.21%, respectively. We have also experimented with different optimizers (e.g. Adadelta and Adagrad) and other data augmentation methods (e.g. height shift and rotation) to further evaluate the proposed method. Using our data augmentation method, accuracy of 98.53% were achieved which is higher than the best accuracy (95.83%) obtained by the other data augmentation methods which have been evaluated. The upper bound on difference between true error rate and empirical error rate of the proposed method has also been provided in order to present better performance analysis. The advantages of employing the proposed method are elimination of contrast agent and its complications, decreased CMR examination time, lower costs for patients and cardiac imaging centers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,734
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,002
Intégrité de la recherche0,0010,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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