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Enregistrement W3171848518 · doi:10.1096/fasebj.2021.35.s1.04337

<i>Saccharomyces cerevisiae</i> Δ9‐desaturase Ole1 Interacts with Lipid Biosynthetic Enzymes that Produce Storage Lipid, Phospholipid, and Sterol‐esters

2021· article· en· W3171848518 sur OpenAlexaff
Brianna Greenwood, David A. Stuart

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiochemistryPhosphatidylethanolamineAcyltransferasesPhospholipidSterolAcyltransferaseBiologyPhosphatidic acidMembrane lipidsChemistryBiosynthesisEnzymePhosphatidylcholineMembraneCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lipids are essential both for integrity of membranes and energy storage in a variety of organisms, from yeast to humans. The chemical properties of membrane phospholipids and triacylglycerol are determined by the composition and organization of their acyl chain components. Acyl‐CoA molecules are delivered to the enzymes involved in lipid biosynthesis in a specific order, as is evidenced by the high prevalence of unsaturated acyl chains in the second position of phosphatidic acid and triacylglycerol in Saccharomyces cerevisiae . The mechanism controlling the specific nature of these lipids is not yet known, but we have previously demonstrated that acyltransferases that produce both storage and membrane lipid interact with the Δ9‐desaturase, Ole1, in a complex we have called the desaturasome. We propose that these interactions determine the incorporation of unsaturated acyl chains into phospholipid and triacylglycerol and thus control the composition of membrane and storage lipids. Yeast two‐hybrid and coimmunoprecipitation studies have revealed novel protein‐protein interactions between Ole1 and storage lipid, phospholipid, and sterol‐ester biosynthesis enzymes. Notably, Ole1 has been found to interact with the acyl‐CoA:sterol acyltransferases Are1 and Are2, phosphatidate cytidylyltransferase Cds1, phosphatidylserine synthase Cho1, phosphatidylinositol synthase Pis1, phosphatidylethanolamine methyltransferase Cho2, and the rate limiting step in sterol synthesis, HMG‐CoA reductase Hmg1. This research has determined the composition of an interactome that may exist to regulate the order of acyl chain incorporation into phospholipid, triacylglycerol, and sterol‐esters. Future research aims to determine exactly how these interactions control lipid synthesis and composition via metabolic flux analysis and gene deletion studies. Investigating this lipid biosynthesis complex will have implications for a wide variety of applied research, from treating lipid dysregulation in humans to biofuel production by microbes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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