MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3172011433 · doi:10.22215/etd/2020-14320

Frozen but alive: Molecular responses to autophagy, angiogenesis and energy metabolism in the stress-tolerant wood frog, Rana sylvatica

2020· dissertation· en· W3172011433 sur OpenAlexafffund
Rasha Al-attar

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyTorporAngiogenesisDehydrationInternal medicineCell biologyEndocrinologyBiochemistryChemistryMedicineThermoregulationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The freeze-tolerant wood frogs (Rana sylvatica) are incredible creatures that can tolerate the freezing of up to ~70% of their total body water during winter.Once frozen, these frogs are considered clinically dead, exhibiting no signs of breathing, heartbeat, muscle movement and nerve conductance; yet, they come back to life, unharmed, after a few hours of thawing.Freezing is associated with ischemia due to the freezing of the blood, with hyperglycemia due to the production of large quantities of glucose for cryoprotection, and with dehydration as water moves from inside the cell to the extracellular space to prevent intracellular freezing.Interestingly, wood frogs can tolerate all these stresses independently of freezing, thereby creating a multifactorial model for studying vertebrate freeze-tolerance.Oxygen availability is very low to non-existing during freezing, anoxia, and dehydration; therefore, wood frogs are hypothesized to reduce their overall metabolic rates to balance energy production with energy expenditure in a process called metabolic rate depression (MRD).Animals that undergo MRD reduce energy expensive or detrimental processes and allocate the limited energy available only to pro-survival responses.This thesis examined the effects of freezing and its associated stress on responses to autophagy, angiogenesis, select group of antioxidant enzymes, and energy metabolism.Molecular responses to autophagy demonstrate a significant reduction in autophagosome formation and lysosomal biogenesis in response to anoxia/reoxygenation and to a lesser degree in response to dehydration/rehydration in liver, whereas these two processes were significantly reduced under all conditions in skeletal muscle.Current results also indicate that angiogenesis is regulated in a temporal and stress-dependent manner, where wood frogs increase the expression of certain pro-IV and anti-angiogenic factors in anticipation of potential damage to capillaries or injury to tissues.Investigation into the role of ETS1 as a transcriptional activator and repressor demonstrated its potential involvement in promoting the expression of select antioxidant enzymes, while repressing the expression of certain nuclear-encoded mitochondrial proteins.Overall, findings in this thesis demonstrate the complexity of the mechanisms involved in controlling metabolic rate depression in adaptive responses in wood frogs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetAutophagy in Disease and Therapy→Travaux en français237 207→