The complete mitochondrial genome and phylogenetic analysis of <i>Coscinodiscus wailesii</i> (Coscinodiscophyceae, Bacillariophyta)
Notice bibliographique
Résumé
Coscinodiscus is a species-rich genus with about 400 species described, many of which are harmful algal bloom species with significant negative ecological impact. Despite of their importance in primary production and as harmful algal bloom species, genome data for species in this genus is limited. No mitochondrial genome (mtDNA) of any species in this genus has been reported. Here, the complete mtDNA sequence of the Coscinodiscus wailesii Gran & Angst 1931 was constructed and analyzed. The circular mtDNA was 36,071 bp in length, encoding 64 genes, including 34 protein coding genes (PCGs), 24 transfer RNA (tRNA) genes, 2 ribosomal RNA (rRNA) genes and 4 conserved open reading frames (orfs). The overall AT content of C. wailesii mtDNA was 75.00%, which was slightly lower than that of Melosira undulate (78.40%). Maximum likelihood (ML) phylogenetic analysis using 29 shared protein-coding genes revealed that C. wailesii clustered well with M. undulata, which was the only species of class Coscinodiscophyceae whose mtDNA has been fully constructed. The complete mtDNAs of more Coscinodiscus species will be valuable for studying the evolutionary relationships among species in the genus Coscinodiscus and in the Class of Coscinodiscophyceae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».