Caspase‐generated neoepitopes as markers of axonal degeneration in neural development and injury
Notice bibliographique
Résumé
Neuronal death, axonal degeneration, and synapse loss are hallmarks of central nervous system development and injury. Commonly employed markers of apoptosis are TUNEL and immunohistochemistry for activated caspases, but these often fail to report axonal degeneration associated with somatic apoptosis. Axonal degeneration is classically detected by silver degeneration stains, but these have limitations (non‐selectivity, minimal reproducibility and incompatibility with co‐labeling). We demonstrate that antibodies to caspase‐cleaved protein substrates beta‐actin (cleaved by caspase 3 at D244) and alpha‐tubulin (cleaved by caspase 6 at D438) enable superior visualization of neurite degeneration. These antibodies label apoptotic cell bodies and neurites during embryonic and postnatal developmental pruning. In addition, they reveal injured neurons and neurites after induction of apoptosis in a mouse model of fetal alcohol syndrome and in sympathetic neuron cultures induced to undergo apoptosis after nerve growth factor withdrawal. Finally, the markers may have clinical utility, as they highlight degenerating neurites in neonatal hypoxic/ischemic injury and in adult patients with multiple sclerosis. Ongoing work aims to identify novel compartment‐specific neoepitopes that will allow monitoring of somatodendritic, axonal, and synaptic remodeling and degeneration. Supported by NS075869.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».