MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3172166231 · doi:10.1096/fasebj.2021.35.s1.02027

Extracellular Matrix Composition Is Altered Alongside Dysmorphology in the Developing Palate

2021· article· en· W3172166231 sur OpenAlexafffund
Nicholas J. Hanne, Diane Hu, Marta Linde‐Medina, Marta Marchini, Benedikt Hallgrímsson, Ralph Marcucio

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCleft Lip and Palate Research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésExtracellular matrixCell biologyFibroblast growth factorLamininMorphogenesisBasement membraneBiologySignal transductionChemistryBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Normal morphogenesis of the primary palate involves directed outgrowth of the facial primordia until they meet and fuse. Gradients of cellular proliferation induced by growth factors are the current paradigm for directed outgrowth, but active cellular migration and physical force propagated through the extracellular matrix (ECM) likely also direct growth. Previously we showed that two of the main components of the ECM, collagen IV and laminin, are thinner in regions of the frontonasal process (FNP) undergoing growth, suggesting tissue stiffness may passively constrain growth in certain directions. We have also shown that increasing Fibroblast growth factor (FGF) signaling in the FNP of chick embryos prior to palate fusion caused overgrowth and disrupted cellular organization. Since cells form and modify the ECM, and since the ECM is required for cellular organization and movement, the effects of FGF signaling on morphogenesis may be due in part to active feedback between ECM and cells. Our goal was to examine the changes to the ECM in the FNP following alteration of FGF signaling. Blocking FGF signaling with SU5402 caused hypoplasia of the FNP and increased the concentration of collagen IV and laminin in regions of expected outgrowth. Conversely, increasing FGF signaling with exogenous FGF2 caused overgrowth of the FNP and decreased concentration of the ECM components. Analysis using transmission electron microscopy of the FGF2 treated samples suggests increasing FGF signaling also decreases the thickness of the epithelium and basement membrane. These results provide preliminary evidence that ECM may play an important role in facial morphogenesis, and that FGF signaling may affect an active biomechanical feedback system between cells and ECM. In the future I will further characterize ECM composition and compliance across the FNP using Fourier transform infrared spectroscopy and atomic force microscopy to generate 3‐dimensional maps of biomechanical properties in the face. I will also use confocal microscopy to map cellular organization across the face. I will overlay these maps onto representative reconstructions of the face to correlate regional variation in biomechanical properties and cellular organization with dysmorphologies that occur following exogenous modulation of FGF signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB JournalMême sujetCleft Lip and Palate ResearchTravaux en français237 207