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Enregistrement W3172179412 · doi:10.3390/metabo11060375

Metabolomics Studies in Psoriatic Disease: A Review

2021· review· en· W3172179412 sur OpenAlexafffund
John Koussiouris, Nikita Looby, Melanie Anderson, Vathany Kulasingam, Vinod Chandran

Notice bibliographique

RevueMetabolites · 2021
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoMemorial University of NewfoundlandUniversity Health Network
Organismes subventionnairesKrembil FoundationUniversity of TorontoPfizer
Mots-clésPsoriatic arthritisPsoriasisMetabolomicsMedicineMetabolomeDiseaseBioinformaticsArthritisMEDLINEComputational biologyInternal medicineBiologyDermatology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metabolomics investigates a broad range of small molecules, allowing researchers to understand disease-related changes downstream of the genome and proteome in response to external environmental stimuli. It is an emerging technology that holds promise in identifying biomarkers and informing the practice of precision medicine. In this review, we summarize the studies that have examined endogenous metabolites in patients with psoriasis and/or psoriatic arthritis using nuclear magnetic resonance (NMR) or mass spectrometry (MS) and were published through 26 January 2021. A standardized protocol was used for extracting data from full-text articles identified by searching OVID Medline ALL, OVID Embase, OVID Cochrane Central Register of Controlled Trials and BIOSIS Citation Index in Web of Science. Thirty-two studies were identified, investigating various sample matrices and employing a wide variety of methods for each step of the metabolomics workflow. The vast majority of studies identified metabolites, mostly amino acids and lipids that may be associated with psoriasis diagnosis and activity. Further exploration is needed to identify and validate metabolomic biomarkers that can accurately and reliably predict which psoriasis patients will develop psoriatic arthritis, differentiate psoriatic arthritis patients from patients with other inflammatory arthritides and measure psoriatic arthritis activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,956
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,408
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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