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Enregistrement W3172227654 · doi:10.1101/2021.05.29.445964

Effect sizes and test-retest reliability of the fMRI-based Neurologic Pain Signature

2021· preprint· en· W3172227654 sur OpenAlexaff
Xiaochun Han, Yoni K. Ashar, Philip A. Kragel, Bogdan Petre, Victoria Schelkun, Lauren Y. Atlas, Luke J. Chang, Marieke Jepma, Leonie Koban, Elizabeth A. Reynolds Losin, Mathieu Roy, Choong‐Wan Woo, Tor D. Wager

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiquePain Management and Placebo Effect
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Center for Complementary and Integrative HealthNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésReliability (semiconductor)Test (biology)PsychologyMultivariate analysis of varianceSample size determinationMultivariate statisticsClinical trialClinical psychologyMedicinePhysical medicine and rehabilitationComputer scienceStatisticsInternal medicineMachine learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Identifying biomarkers that predict mental states with large effect sizes and high test-retest reliability is a growing priority for fMRI research. We examined a well-established multivariate brain measure that tracks pain induced by nociceptive input, the Neurologic Pain Signature (NPS). In N = 295 participants across eight studies, NPS responses showed a very large effect size in predicting within-person single-trial pain reports (d = 1.45) and medium effect size in predicting individual differences in pain reports (d = 0.49). The NPS showed excellent shortterm (within-day) test-retest reliability (ICC = 0.84, with average 69.5 trials/person). Reliability scaled with the number of trials within-person, with ≥60 trials required for excellent test-retest reliability. Reliability was tested in two additional studies across 5-day (N = 29, ICC = 0.74, 30 trials/person) and 1-month (N = 40, ICC = 0.46, 5 trials/person) test-retest intervals. The combination of strong within-person correlations and only modest between-person correlations between the NPS and pain reports indicate that the two measures have different sources of between-person variance. The NPS is not a surrogate for individual differences in pain reports but can serve as a reliable measure of pain-related physiology and mechanistic target for interventions. Significance statement Current efforts towards translating brain biomarkers require identifying brain measures that can strongly and reliably predict outcomes of interest. We systematically examined the performance of a well-established brain activity pattern, the Neurological Pain Signature (NPS), in a large and diverse sample of participants. The NPS showed excellent reliability, and the reliability scaled with the number of trials within-person. The NPS responses showed strong correlations with pain reports at the within-person level but only modest correlations at the between-person level. The findings suggest that the NPS is not a surrogate for individual differences in pain reports but can serve as a reliable measure of a pain-related physiological target. Author Note This project was supported by grants R01MH076136 (T.D.W.), R01DA046064, R01EB026549, and R01DA035484. Elizabeth A. Reynolds Losin was supported by a Mentored Research Scientist Development award from National Institute On Drug Abuse of the National Institutes of Health (K01DA045735). Lauren Y. Atlas was supported in part by funding from the Intramural Research Program of the National Center for Complementary and Integrative Health. Yoni K. Ashar was supported by NCATS Grant # TL1-TR-002386. The content is solely the responsibility of the authors and does not necessarily represent the official views of the National Institutes of Health. Code for all analyses and figures is available at https://github.com/XiaochunHan/NPS_measurement_properties . Data for all analyses and figures is available at https://osf.io/v9px7/ .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,051
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,051
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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