Characterizing a role for NuA4 in the regulation of ergosterol in yeast
Notice bibliographique
Résumé
NuA4 is an essential lysine acetyltransferase (KAT) in yeast and is homologous to Tip60, a disease relevant protein complex in mammalian cells. As our lab and others have recently identified a novel role for NuA4 in lipid regulation, we performed a global lipidomic analysis. We determined that two mutants of NuA4, a temperature sensitive mutant of the catalytic subunit ( esa1‐ts ) and deletion of the non‐essential scaffolding subunit ( eaf1 Δ), have an increase in the relative abundance of ergosteryl esters, the yeast equivalent to cholesteryl esters. Following this discovery, we have also found that the NuA4 mutants have altered sensitivity to many compounds which target ergosterol synthesis and ergosterol in the membrane. This suggests that ergosterol regulation in NuA4 mutants may be altered. We are working to measure ergosterol directly in these mutants as well as to determine how NuA4 may affect ergosterol regulation in the cell. Specifically, we are using the deletion mutant array, a collection of yeast strains with each gene deleted, to look for genes that reverse the sensitivity of NuA4 mutants to ergosterol targeting compounds such as Amphotericin B and Nystatin. Overall, this study aims to characterize changes in ergosterol regulation in yeast NuA4 mutants. Given the exceptional conservation of KAT function across eukaryotes, this may provide insight into understanding the biological roles of Tip60 in lipid regulation and the cellular consequences of its deregulation in disease.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».