MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3172681723 · doi:10.1038/s41467-022-30695-9

The Medical Segmentation Decathlon

2022· article· en· W3172681723 sur OpenAlexaff
Michela Antonelli, Annika Reinke, Spyridon Bakas, Keyvan Farahani, Annette Kopp‐Schneider, Bennett A. Landman, Geert Litjens, Bjoern Menze, Olaf Ronneberger, Ronald M. Summers, Bram van Ginneken, Michel Bilello, Patrick Bilic, Patrick Ferdinand Christ, Richard Kinh Gian, Marc J. Gollub, Stephan Heckers, Henkjan Huisman, William R. Jarnagin, Maureen McHugo, Sandy Napel, Jennifer S. Golia Pernicka, Kawal Rhode, Catalina Tobon‐Gomez, Eugene Vorontsov, James Meakin, Sébastien Ourselin, Manuel Wiesenfarth, Pablo Arbeláez, Byeonguk Bae, Sihong Chen, Laura Daza, Jianjiang Feng, Baochun He, Fabian Isensee, Yuanfeng Ji, Fucang Jia, Ildoo Kim, Klaus Maier‐Hein, Dorit Merhof, Akshay Pai, Beomhee Park, Mathias Perslev, R. Rezaiifar, Oliver Rippel, Ignacio Sarasúa, Wei Shen, Jaemin Son, Christian Wachinger, Liansheng Wang, Yan Wang, Yingda Xia, Daguang Xu, Zhanwei Xu, Yefeng Zheng, Amber L. Simpson, Lena Maier‐Hein, M. Jorge Cardoso

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensQueen's UniversityPolytechnique Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNIH Clinical CenterNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthEngineering and Physical Sciences Research CouncilKWF KankerbestrijdingNational Institute for Health and Care ResearchSiemens HealthineersUK Research and InnovationNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekWellcome Trust
Mots-clésGeneralizability theorySegmentationComputer scienceTask (project management)Set (abstract data type)Artificial intelligenceMachine learningImage segmentationModalitiesImage (mathematics)Range (aeronautics)Pattern recognition (psychology)Mathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

International challenges have become the de facto standard for comparative assessment of image analysis algorithms. Although segmentation is the most widely investigated medical image processing task, the various challenges have been organized to focus only on specific clinical tasks. We organized the Medical Segmentation Decathlon (MSD)-a biomedical image analysis challenge, in which algorithms compete in a multitude of both tasks and modalities to investigate the hypothesis that a method capable of performing well on multiple tasks will generalize well to a previously unseen task and potentially outperform a custom-designed solution. MSD results confirmed this hypothesis, moreover, MSD winner continued generalizing well to a wide range of other clinical problems for the next two years. Three main conclusions can be drawn from this study: (1) state-of-the-art image segmentation algorithms generalize well when retrained on unseen tasks; (2) consistent algorithmic performance across multiple tasks is a strong surrogate of algorithmic generalizability; (3) the training of accurate AI segmentation models is now commoditized to scientists that are not versed in AI model training.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,031
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,082

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,031
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0020,003
Communication savante0,0050,005
Science ouverte0,0030,009
Intégrité de la recherche0,0050,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 202
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature CommunicationsMême sujetRadiomics and Machine Learning in Medical ImagingTravaux en français237 207