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Enregistrement W3172814911 · doi:10.1002/cti2.1289

Differential transcriptional and functional properties of regulatory T cells in HIV‐infected individuals on antiretroviral therapy and long‐term non‐progressors

2021· article· en· W3172814911 sur OpenAlexafffund
Shima Shahbaz, Juan Jovel, Shokrollah Elahi

Notice bibliographique

RevueClinical & Translational Immunology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesFaculty of Medicine and Dentistry, University of AlbertaCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Alberta
Mots-clésAntiretroviral therapyHuman immunodeficiency virus (HIV)Term (time)Differential (mechanical device)ImmunologyBiologyVirologyViral loadMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objectives Regulatory T cells (Tregs) are widely recognised as a subset of CD4 + CD25 + FOXP3 + T cells that have a key role in maintaining immune homeostasis. The impact of HIV‐1 infection on immunological properties and effector functions of Tregs has remained the topic of debate and controversy. In the present study, we investigated transcriptional profile and functional properties of Tregs in HIV‐1‐infected individuals either receiving antiretroviral therapy (ART, n = 50) or long‐term non‐progressors (LTNPs, n = 24) compared to healthy controls (HCs, n = 38). Methods RNA sequencing (RNAseq), flow cytometry‐based immunophenotyping and functional assays were performed to study Tregs in different HIV cohorts. Results Our RNAseq analysis revealed that Tregs exhibit different transcriptional profiles in HIV‐infected individuals. While Tregs from patients on ART upregulate pathways associated with a more suppressive (activated) phenotype, Tregs in LTNPs exhibit upregulation of pathways associated with impaired suppressive properties. These observations may explain a higher propensity for autoimmune diseases in LTNPs. Also, we found substantial upregulation of HLA‐F mRNA and HLA‐F protein in Tregs from HIV‐infected subjects compared to healthy individuals. These observations highlight a potential role for this non‐classical HLA in Tregs in the context of HIV infection, which should be investigated further in other chronic viral infections and cancer. Conclusion Our study has provided a novel insight into Tregs at the transcriptional and functional levels in different HIV‐infected groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,422
Score d'incertitude au seuil0,785

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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