Herpes simplex virus PCR in 2230 explanted corneal buttons
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: To determine herpes simplex virus (HSV) DNA prevalence and mean cycle threshold of polymerase chain reaction (PCR) in corneal tissue of patients with penetrating keratoplasty (PKP), with (HSK+) and without (HSK-) previous clinical herpetic keratitis history. METHODS: Retrospective review of recipient corneal buttons which were explanted through PKP between March 2010 and September 2018 at the Department of Ophthalmology, Saarland University Medical Center in Homburg/Saar, Germany. Corneal tissue samples were analysed by real-time PCR for the presence of HSV DNA. For each subject, clinical data, including patients' demographics and clinical diagnoses, were collected. RESULTS: In total, 2230 corneal samples (age at the time of the surgery 57.3 ± 19.2 years) of 1860 patients were analysed. HSV PCR was positive in 137 (6.1%) corneal samples, with a 30.57 ± 6.01 (range 14-39) mean cycle threshold (Ct) value. Two hundred ninety-eight (13.4%) corneas of 266 patients were clinically HSK+, and 1932 (86.6%) corneas of 1600 patients were clinically HSK-. HSV DNA was detected significantly more frequently (p < 0.0001) in HSK+ corneal samples (108 corneal samples; 36.2%), than in HSK- corneal samples (29 corneal samples; 1.5%). Ct value was significantly lower in HSK+ than in HSK- corneal samples (29.8 ± 5.8 versus 32.6 ± 5.9; p = 0.008). CONCLUSION: Our data demonstrate that a positive clinical history of HSK is related to HSV PCR positivity in about every 2.8th patient. In addition, about every 66th explanted corneal tissue is HSV PCR-positive despite the lack of clinical suspicion. These patients may need additional local/systemic antiviral treatment to avoid newly acquired HSK following penetrating keratoplasty.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».