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Enregistrement W3173186378 · doi:10.1096/fasebj.20.5.a891-c

Investigations into the membrane‐intrinsic domain of <i>Escherichia coli</i> succinate dehydrogenase

2006· article· en· W3173186378 sur OpenAlexaff
Quang M. Tran, Richard A. Rothery, Joël H. Weiner

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryHemeSuccinate dehydrogenaseFlavin groupElectron transport chainCatalytic cycleElectron transferOxidoreductaseBiochemistryFlavin adenine dinucleotideEnzymeCofactorStereochemistryPhotochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Escherichia coli succinate dehydrogenase is a heterotetrameric complex II homolog with dual roles in the TCA cycle and the electron transport chain. Oxidation of succinate at a cytosolic flavin adenine dinucleotide (FAD) is coupled to reduction of ubiquinone within the membrane domain. The membrane‐intrinsic domain contains a heme co‐factor of unknown function. Interestingly, the same catalytic reactions can be carried out by other complex II homologues but in the absence of the heme moiety. This study examines the membrane‐bound domain of Sdh in order to find catalytically‐important amino acid residues as well as determine the pathway of electron transfer from FAD to quinone. We have found that several residues found within the Q‐site are essential for enzyme catalysis – SdhC‐Ser27, SdhC‐Arg31, and SdhD‐D82 – and mutations here result in functionally inactive enzymes. Moreover, these mutations also destabilize a ubisemiquinone radical intermediate as determined by electron paramagnetic resonance. When reduction of the heme is examined spectrophotometrically upon the addition of succinate, mutants within the Q‐site have a effect not only on the extent of heme reduction, but also significantly lower the rate at which electrons flow to the heme. These results lead to two conclusions: i) turnover of the enzyme requires a ubisemiquinone intermediate and ii) the heme participates in the electron transfer pathway but heme reduction is dependent on a functionally active Q‐site.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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