Investigations into the membrane‐intrinsic domain of <i>Escherichia coli</i> succinate dehydrogenase
Notice bibliographique
Résumé
Escherichia coli succinate dehydrogenase is a heterotetrameric complex II homolog with dual roles in the TCA cycle and the electron transport chain. Oxidation of succinate at a cytosolic flavin adenine dinucleotide (FAD) is coupled to reduction of ubiquinone within the membrane domain. The membrane‐intrinsic domain contains a heme co‐factor of unknown function. Interestingly, the same catalytic reactions can be carried out by other complex II homologues but in the absence of the heme moiety. This study examines the membrane‐bound domain of Sdh in order to find catalytically‐important amino acid residues as well as determine the pathway of electron transfer from FAD to quinone. We have found that several residues found within the Q‐site are essential for enzyme catalysis – SdhC‐Ser27, SdhC‐Arg31, and SdhD‐D82 – and mutations here result in functionally inactive enzymes. Moreover, these mutations also destabilize a ubisemiquinone radical intermediate as determined by electron paramagnetic resonance. When reduction of the heme is examined spectrophotometrically upon the addition of succinate, mutants within the Q‐site have a effect not only on the extent of heme reduction, but also significantly lower the rate at which electrons flow to the heme. These results lead to two conclusions: i) turnover of the enzyme requires a ubisemiquinone intermediate and ii) the heme participates in the electron transfer pathway but heme reduction is dependent on a functionally active Q‐site.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».