Structural Insights into the Role of PHD Fingers in the MOZ/MORF and HBO1 HATs
Notice bibliographique
Résumé
The MOZ/MORF and HBO1 histone acetyltransferases (HATs) are important for regulation of many cellular processes including transcription activation, DNA repair and development. They form multi‐subunit complexes that contain several distinct plant‐homeodomains (PHD). PHD fingers were originally discovered to bind post‐transcriptional modifications (PTMs) on the histone H3 tail, particularly tri‐methylation at lysine 4 (H3K4me3). Current research indicates PHD fingers are divided into functional classes that bind other PTMs as well. The ING4, ING5, BRPF1 and Jade1 subunits of MOZ/MORF and HBO1 all harbor PHD fingers, however, the functional role of these PHD modules has not been determined. We aimed to elucidate the different substrate specificity and function of PHD fingers within MOZ/MORF and HBO1 towards histone tails using X‐ray crystallography, NMR, fluorescence spectroscopy and mutagenesis. Here we report the crystal structures of ING4 and ING5 in complex with the H3K4me3 histone peptide, the binding of Jade1 and BRPF1 to the unmodified H3 tail, and affinities of the PHD finger:histone interaction. Functional analysis indicates both the ING4/5 subunits and methylated H3K4 regulate enzymatic activity. Together these studies provide an essential link between HAT activity and chromatin remodeling, and impart a greater understanding on how the histone code is read.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».