Proteome of breast cancer derived microvesicles
Notice bibliographique
Résumé
The aim of the research. To examine the proteomic profi le of breast cancer exosomes. Material and methods. Cell lines used for this study were MDA-MB-231 female epithelial breast cancer cells (ATCC HTB-26) and MCF10A non-tumorigenic epithelial breast tissue cells. MVs were isolated using diff erential ultracentrifugation. Samples were lysed, reduced, alkylated, digested, and analyzed by an Orbitrap Fusion mass spectrometer. MS raw fi les were analyzed using MaxQuant version 1.6.12.0. Peptides were searched against the human UniProt FASTA database using the Andromeda search engine, integrated into MaxQuant. Results. MVs derived from MCF10A and MDA-MB-231 cell lines were analyzed, and 1427 and 547 proteins were identifi ed in the MDA-MB-231 and MCF10A-derived MVs, respectively. In total, 455 proteins were common to both MDA-MB-231 and MCF10A MVs. MVs derived from MCF10A and MDAMB-231 cell lines were analyzed, and 1427 and 547 proteins were identifi ed in the MDA-MB-231 and MCF10A-derived MVs, respectively. In total, 455 proteins were common to both MDA-MB-231 and MCF10A MVs. Th e unique MDA-MB-231 MV proteins were searched against the DisGeNET human diseases database. Out of 972 MDA-MB-231 MV proteins, 112 were cancer-related while 32 were specifi cally associated with BC. In the MDA-MB-231 MV proteome, 23 Wnt signaling pathway proteins were identifi ed based on their GO biological process. Proteomic analysis identifi ed enzymes OAT, TALDO1, and BLMH were only in MVs from metastatic MDA-MB-231 cell line. The specific activity of OAT and TALDO1 was higher in MV fractions of MDA-MB-231 in comparison to the non-cancerous MCF10A cell line-derived MVs. Th ese fi ndings might suggest that these enzymes might play a role in BC. In our present study, we found that some enzymes identifi ed from MV fractions were already proposed to play a role in cancer therapy as therapeutic targets (OAT, TALDO1) and resistance against chemotherapy agents (BLMH).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».