International Association for Plant Taxonomy 2021 Stebbins Medal
Notice bibliographique
Résumé
Luke T. Dunning, Jill K. Olofsson, Christian Parisod, Rimjhim R. Choudhury, Jose J. Moreno-Villena, Yang Yang, Jacqueline Dionora, W. Paul Quick, Minkyu Park, Jeffrey L. Bennetzen, Guillaume Besnard, Patrik Nosil, Colin P. Osborne & Pascal-Antoine Christin. 2019. Lateral transfers of large DNA fragments spread functional genes among grasses. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 116(10): 4416–4425. https://www.pnas.org/content/116/10/4416.short The Stebbins Medal was first awarded in 2003 in honour of the American botanist and geneticist George Ledyard Stebbins (1906–2000), one of the world's leading plant evolutionary biologists of the 20th century. The medal is awarded biennially by IAPT for an outstanding paper in phylogenetic systematics and evolution of plants. The 2021 award considered papers published in 2018 and 2019. In their paper, Dunning & al. presented the most thorough and far-reaching study to date that convincingly demonstrates extensive lateral gene transfer (LGT) in plants. By comparing genomes of many grasses, they showed that large blocks of DNA containing functional genes are laterally passed among species that are distantly related across the grass phylogeny. Through stringent phylogenomic analyses, they discovered 59 LGTs clustered on 23 laterally acquired genomic fragments that are up to 170 kb long in the genome of the grass Alloteropsis semialata (R.Br.) Hitchc., involving at least nine different donor species. They also showed that some of these laterally transferred genes have added functions to the recipient species genomes. This suggests that LGT represents a potent evolutionary force capable of spreading functional genes among distantly related lineages of grasses. Luke Dunning (Fig. 1), the first author of the 2021 Stebbins Medal paper, studied for his Bachelor's Degree at Cardiff University, Wales, United Kingdom and his Ph.D. at the University of Auckland in New Zealand. Since October 2020, he holds a Natural Environment Research Council (NERC) Independent Research Fellowship in the Department of Animal and Plant Sciences at the University of Sheffield, U.K. Previously, he worked as a postdoctoral researcher with Pascal-Antoine Christin, the senior author of the winning paper, also at the University of Sheffield. Luke's work focuses on the genomics of rapid adaptation in grasses and combines cutting-edge genomic techniques, comparative analyses and experimental approaches to understand how organisms adapt to their environment (https://dunning-lab.group.shef.ac.uk). Many congratulations to Luke Dunning and colleagues! The Stebbins Award committee comprises Paula Rudall (U.K.), Loren Rieseberg (Canada) and Colin Hughes, Chair (Switzerland). The IAPT Council is grateful to the committee for their hard work in making this outstanding selection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».