Mitochondrial Genetic Diversity among Farmed Stocks of Oreochromis spp. (Perciformes, Cichlidae) in Madagascar
Notice bibliographique
Résumé
The fast development of aquaculture over the past decades has made it the main source of fish protein and led to its integration into the global food system. Mostly originating from inland production systems, aquaculture has emerged as strategy to decrease malnutrition in low-income countries. The Nile tilapia (Oreochromis niloticus) was introduced to Madagascar in the 1950s, and is now produced nationally at various scales. Aquaculture mostly relies on fry harvested from wild populations and grow-out in ponds for decades. It has recently been diversified by the introduction of several fast-growing strains. Little is known how local genetic diversity compares to recently introduced strains, although high and comparable levels of genetic diversity have previously been observed for both wild populations and local stocks. Our study compares DNA barcode genetic diversity among eight farms and several strains belonging to three species sampled. DNA-based lineage delimitation methods were applied and resulted in the detection of six well differentiated and highly divergent lineages. A comparison of DNA barcode records to sequences on the Barcode of Life Data System (BOLD) helped to trace the origin of several of them. Both haplotype and nucleotide diversity indices highlight high levels of mitochondrial genetic diversity, with several local strains displaying higher diversity than recently introduced strains. This allows for multiple options to maintain high levels of genetic diversity in broodstock and provides more options for selective breeding programs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».