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Enregistrement W3173531951 · doi:10.1002/cjce.24232

Optimization of operation conditions for improved cytochrome <scp>P450BM3</scp> enzymatic reaction yield

2021· article· en· W3173531951 sur OpenAlexafffundvenue
Thierry Vincent, Bruno Gaillet, Alain Garnier

Notice bibliographique

RevueThe Canadian Journal of Chemical Engineering · 2021
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCofactorChemistryHydroxylationYield (engineering)RedoxEnzymeBacillus megateriumHemeMonooxygenaseCytochromeBiocatalysisNAD+ kinaseCytochrome P450StereochemistryCombinatorial chemistryBiochemistryCatalysisOrganic chemistryReaction mechanismBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The P450 cytochrome monooxygenase CYP102A1 from Bacillus megaterium , better known as P450BM3, is a heme‐thiolate enzyme that catalyzes the hydroxylation of numerous substrates. Many of the resulting products are of commercial interest to the pharmaceutical and fine chemical industries. Unlike most other P450 cytochromes, P450BM3 is both soluble and fused to its natural redox partner, which supplies the necessary electrons from NADPH to drive its reaction forward. However, the industrial use of this enzyme is limited by its poor stability and its expensive cofactor. In this work, we explore the effects of buffer formulation and temperature on the stability of wildtype and P450BM3 mutant R966D/W1046S as well as on the stability of nicotinamide cofactors NADPH, NADH, and the biomimetic cofactor N‐benzyl‐1,4‐dihydronicotinamide. We demonstrate that cofactor stability is more important to increase product yield than that of the enzyme. We also demonstrate that low temperatures enhance oxido‐reduction reactions coupling, thus resulting in an increase in the molar ratio of p‐ nitrophenolate produced from 10‐ p NCA per oxidized cofactor. Overall, the optimized reaction conditions lead to a 2 to 2.6‐fold increase in total product output when wildtype P450BM3 or R966D/W1046S mutant is used with either of these three aforementioned cofactors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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