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Consequences of Cytochrome <i>c</i> Oxidase Assembly Defects for the Yeast Stationary Phase

2018· article· en· W3173542323 sur OpenAlexaffabout
Alicia Dubinski, D. Moira Glerum

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCytochrome c oxidaseMitochondrionMitophagyCell biologyOxidative phosphorylationBiologyBiochemistryOxidative stressRespiratory chainYeastBioenergeticsChemistryAutophagyApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Functional assembly of cytochrome c oxidase (COX) is essential for an intact mitochondrial respiratory chain, although the consequences of a loss of assembled COX at yeast stationary phase remain largely unexplored. Stationary phase cultures are a good model for terminally differentiated cells in humans, such as neurons. Our goal is to define the physiological changes in mitochondrial respiration and oxidative stress between exponential and stationary phases in a respiratory competent strain and a set of COX assembly mutants with defects in a variety of aspects related to enzyme assembly. These results further our understanding of mitochondrial changes in terminally differentiated cells and aging cells. In this study, we show that a wild‐type respiratory competent yeast strain at stationary phase is characterized by a decreased oxidative capacity, as seen by a reduction in the amount of assembled COX, which is supported by a decrease in protein levels of several COX assembly factors. Wild‐type cells also have a disrupted mitochondrial reticulum during stationary phase. Loss of assembled COX results in the decreased abundance of many mitochondrial proteins at stationary phase, which we show is likely due to decreased membrane potential and changes in mitophagy. In addition to an altered mitochondrial proteome, COX assembly mutants display unexpected changes in markers of cellular oxidative stress at stationary phase. Specifically, differences in distribution of Sod1 between exponential and stationary phases give insight on location of reactive oxygen species (ROS) in the cell. Our results suggest that mitochondria may not be a major source of ROS at stationary phase in cells lacking an intact respiratory chain. Overall, we have identified fundamental differences between exponential and stationary phase mitochondria in respiratory competent yeast and have defined two distinct phenotypes, decreased levels of mitochondrial proteins and less mitochondrial oxidative damage, in cells with a defective respiratory chain. These findings suggest that COX deficiencies are associated with broader cellular phenotypes in terminally differentiated cells in humans. Support or Funding Information Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC) This abstract is from the Experimental Biology 2018 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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