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Enregistrement W3173571517 · doi:10.30630/joiv.5.2.572

3D CNN based Alzheimer’s diseases classification using segmented Grey matter extracted from whole-brain MRI

2021· article· en· W3173571517 sur OpenAlexfundno aff
Bijen Khagi, Goo‐Rak Kwon

Notice bibliographique

RevueJOIV International Journal on Informatics Visualization · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueBrain Tumor Detection and Classification
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiMeso Scale DiagnosticsNational Research Foundation of KoreaChosun UniversityNational Research FoundationNorthern California Institute for Research and EducationNovartis Pharmaceuticals CorporationMinistry of Science and ICT, South KoreaBiogenBioClinicaUniversity of Southern CaliforniaU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbNational Institute on AgingAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésGrey matterMagnetic resonance imagingDementiaVoxelVoxel-based morphometryConvolutional neural networkNeuroimagingArtificial intelligencePositron emission tomographyNuclear medicineFeature (linguistics)MedicinePattern recognition (psychology)Computer scienceRadiologyPsychologyNeurosciencePathologyWhite matterDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A recent study from MRI has revealed that there is a minor increase in cerebral-spinal fluid (CSF) content in brain ventricles and sulci, along with a substantial decrease in grey matter (GM) content and brain volume among Alzheimer's disease (AD) patients. It has been discovered that the grey matter volume shrinkage may indicate the possible case of dementia and related diseases like AD. Clinicians and radiologists use imaging techniques like Magnetic Resonance Imaging (MRI), Computed Tomography (CT) scan, and Positron Emission Tomography (PET) to diagnose and visualize the tissue contents of the brain. Using the whole brain MRI as the feature is an on-going approach among machine learning researchers, however, we are interested only in grey matter content. First, we segment the MRI using the SPM (Statistical parameter mapping) tool and then apply the smoothing technique to get a 3D image of grey matter (later called as grey version) from each MRI. This image file is then fed into 3D convolutional neural network (CNN) with necessary pre-processing so that it can train the network, to produce a classifying model. Once trained, an untested MRI (i.e. its grey version) can be passed through the CNN to determine whether it is a healthy control (HC), or Mild Cognitive Impairment (MCI) due to AD (mAD) or AD dementia (ADD). Our validation and testing accuracy are reported here and compared with normal MRI and its grey version.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,826
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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