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Lysophosphatidylcholine Analogues Alter Yeast Nuclear Envelope Architecture and Function

2018· article· en· W3173658563 sur OpenAlexafffundabout
Maria Laura Sosa Ponce, Jennifer A. Cobb, Vanina Zaremberg

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésLysophosphatidylcholineChromatinSaccharomyces cerevisiaeCell biologyTelomereBiologyGene silencingChemistryBiochemistryYeastDNAGeneMembranePhospholipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The lysophosphatidylcholine analog edelfosine is an anticancer lipid drug that targets cellular membranes. Therefore, it is alleged that in contrast to other chemotherapeutic agents edelfosine does not impact DNA. Despite this claim, a genetic screen in Saccharomyces cerevisiae found that lack of s ilent i nformation r egulator (Sir) proteins, alleviated the toxic effect of edelfosine. Since Sir proteins are key architects and regulators of the genome, we decided to investigate if this unusual connection with edelfosine could be related to a potential effect of the lysophosphatidylcholine analog on the nuclear envelope (NE) structure and function. Indeed, we found that edelfosine alters NE morphology, leading to an abnormal elongation of the membrane. Since it is known that Sir proteins mediate tethering of subtelomeric chromatin to the NE, we investigated if this was affected by treatment of wild type cells with the drug. Results from chromatin immunoprecipitation of Sir4 showed a significant reduction in the association of the protein with telomeres when cells were treated with edelfosine. Current evidence also supports alterations of telomere clustering in the presence of the lysophosphatidylcholine analogue. Therefore, our results suggest that edelfosine alters NE morphology and function. We speculate that mislocalization of Sir proteins in the nucleus probably results in abnormal silencing of genes that may be implicated in pathways that confer resistance to this lysophosphatidylcholine analog. Support or Funding Information This work has been financially supported by the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada to V Zaremberg and JA Cobb. This abstract is from the Experimental Biology 2018 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,647
Score d'incertitude au seuil0,230

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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