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Enregistrement W3173669335 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.523.9

Pathogenic E. coli Cause Global Decreases in Ubiquitylated Host Cell Proteins

2013· article· en· W3173669335 sur OpenAlexafffund
Ann E. Lin, Julian A. Guttman

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésUbiquitinBiologyExtracellularCell biologyPlasmidUbiquitin ligaseMicrobiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Enteropathogenic E. coli (EPEC) infections cause severe infantile diarrhea, leading to high mortality in developing countries. These pathogens extensively alter normal host cell functions while remaining extracellular. Ubiquitylation is a widespread post‐translational regulatory system that governs a wide range of cellular events. This process relies on a heierarchical relay system, comprised of E1, E2 and E3 enzymes. Effects of EPEC on the host ubiquitin‐conjugation process have remained elusive. Thus, we sought to test the hypothesis that EPEC alter normal ubiquitylation signaling pathways during their infections. To test this, we infected epithelial cells with EPEC and monitored ubiquitylated protein levels by immunoblotting. We found that the presence of a large plasmid within EPEC called the E. coli adherence factor (EAF) caused a significant decrease in the overall levels of ubiquitylated host proteins. This occurred with a concomitant loss of host E1 activating enzymes, which are essential for initiating the ubiquitylation cascade. We conclude that EPEC exploits E1 enzymes to influence global protein regulatory cascades that are crucial for normal cellular functions. This novel strategy highlights that pathogens can exploit key targets to influence overall protein regulatory systems that are needed for normal cellular functions and disease progression. Grant Funding Source : CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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