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Enregistrement W3173704515 · doi:10.1016/j.xcrp.2021.100477

Topologically non-trivial metal-organic assemblies inhibit β2-microglobulin amyloidogenesis

2021· article· en· W3173704515 sur OpenAlexfundno aff
Thirumurugan Prakasam, Yamanappa Hunashal, Cristina Cantarutti, Sofia Giorgetti, Giulia Faravelli, Valentina Mondani, Sudhir Kumar Sharma, Ramesh Jagannathan, Giovanni Palmisano, Vittorio Bellotti, Federico Fogolari, John-Carl Olsen, Ali Trabolsi, Gennaro Esposito

Notice bibliographique

RevueCell Reports Physical Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDepartment of Education and KnowledgeYork UniversityNew York University Abu Dhabi
Mots-clésFibrillogenesisBeta-2 microglobulinChemistryBiophysicsCatenaneCrystallographyIn vitroKnot (papermaking)StereochemistryBiochemistryMoleculeBiologyMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inhibiting amyloid aggregation through high-turnover dynamic interactions could be an efficient strategy that is already used by small heat-shock proteins in different biological contexts. We report the interactions of three topologically non-trivial, zinc-templated metal-organic assemblies, a [2]catenane, a trefoil knot (TK), and Borromean rings, with two β2-microglobulin (β2m) variants responsible for amyloidotic pathologies. Fast exchange and similar patterns of preferred contact surface are observed by NMR, consistent with molecular dynamics simulations. In vitro fibrillation is inhibited by each complex, whereas the zinc-free TK induces protein aggregation and does not inhibit fibrillogenesis. The metal coordination imposes structural rigidity that determines the contact area on the β2m surface depending on the complex dimensions, ensuring in vitro prevention of fibrillogenesis. Administration of TK, the best protein-contacting species, to a disease-model organism, namely a Caenorhabditis elegans mutant expressing the D76N β2m variant, confirms the bioactivity potential of the knot topology and suggests new developments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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