Elucidation of the <i>Pax‐5/</i> miRNA interactome and its oncogenic effects in cancer cells
Notice bibliographique
Résumé
The Pax‐5 oncogene has consistently been associated to B cell cancer lesions and more recently solid tumors including breast carcinoma. Although Pax‐5 downstream activity is relatively well characterized, aberrant Pax‐5 expression in a cancer specific context is poorly understood. To investigate the regulation of Pax‐5 expression, we studied micro‐RNAs (miRNAs) and mRNA polymorphism in cancer cells. Using bioinformatics and next‐generation sequencing, we found that miRNAs 484 and 210 are aberrantly expressed in breast cancer and predicted to target Pax‐5 mRNA. Through conditional modulation of these miRNAs, we demonstrate that miRNA‐484 and 210 inhibit Pax‐5 expression and regulate Pax‐5‐associated cancer processes. In validation, we show that these effects are reversible by either Pax‐5 recombinant overexpression; or, selective miRNA inhibition. On the other hand, upon our analysis of the Pax‐5 transcript, we found that not only is the 3′UTR submitted to alternative polyadenylation; but also, alternative splicing of the Pax‐5 mRNA 3′UTR. These transcript polymorphism events lead to the shortening of the Pax‐5 3′UTR which resulted in greater oncogene translation frequency. More importantly, we also found that Pax‐5 transcripts characterized with shorter 3′UTRs were associated with advanced staging of cancer lesions. Our findings identify novel molecular mechanisms, which account for Pax‐5 aberrant expression and function in cancer cells. These findings will further elucidate Pax‐5 ‐mediated cancer processes and may provide new avenues for therapeutic intervention. Support or Funding Information This work was supported by grants from the New Brunswick (NB) Innovation Foundation, the Canadian Breast Cancer Foundation, the Canadian Breast Cancer Society/QEII Foundation, the NB Health Research Foundation and by the Beatrice Hunter Cancer Research Institute This abstract is from the Experimental Biology 2019 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».