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G Protein‐Coupled Receptors in Human Lung Fibroblasts: Novel Therapeutic Approaches for Idiopathic Pulmonary Fibrosis?

2018· article· en· W3174074055 sur OpenAlexafffund
Alexander V. Michkov, Krishna Sriram, Subhendu Mukherjee, Luke J. Janssen, Paul A. Insel

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInterstitial Lung Diseases and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésMyofibroblastFibroblastG protein-coupled receptorIdiopathic pulmonary fibrosisExtracellular matrixLungReceptorFibrosisPulmonary fibrosisCancer researchCell biologyBiologySignal transductionChemistryPathologyMedicineInternal medicineCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Idiopathic Pulmonary Fibrosis (IPF) is a progressive, often fatal interstitial lung disease and thus in need of new, effective therapies. A feature of IPF is fibroblast‐to‐myofibroblast transition and resultant increased deposition of extracellular matrix (ECM) proteins, which can lead to loss of functional lung tissue. Previous studies have shown that increases in cyclic AMP (cAMP) can decrease the number and function of myofibroblasts. Cellular synthesis of cAMP is mediated by adenylyl cyclase, the activity of which is regulated by G‐protein signaling and G‐protein coupled receptors (GPCRs). We hypothesized that alteration in GPCR expression in lung fibroblasts from IPF patients may identify new therapeutic targets for lung fibrosis. Using RNA‐seq, we have identified and quantified GPCRs of lung fibroblasts isolated from six IPF patients and six controls grown in low passage primary cultures. RNA‐seq analysis revealed the expression of ~120 GPCRs (of ~380 endoGPCRs [regulated by endogenous ligands]). On average ~20 highly expressed GPCR were detected in all samples, with small differences in biological replicates; these may be “housekeeping” GPCRs. We also identified a group of GPCRs with highly variable expression and found that lung fibroblasts from IPF patients selectively expressed a subset of GPCRs. To assess changes in GPCR expression during fibroblast‐to‐myofibroblast transition, we treated fibroblasts with TGFβ1 (10 ng/ml, 48 hrs or 20 ng/ml, 16 hrs). As expected, TGFβ1 treatment increased the expression of pro‐fibrotic markers (e.g., collagens Iα1, Iα2, III; α‐smooth muscle actin; plasminogen activator inhibitor‐1). In addition, TGFβ1 altered (increased or decreased) the expression of numerous GPCRs. TGFβ1 treatment of control fibroblasts did not fully mimic the GPCR expression changes of fibroblasts from IPF patients. We conclude that GPCR expression (GPCRomic) analysis identifies GPCRs that may contribute to the fibrotic state in the lung and thus, may be novel therapeutic targets for lung fibrosis. Support or Funding Information Supported by NIH T32 HL 098062‐04, Bristol Myers Squibb and CIHR 201403MOP‐RS‐323925. This abstract is from the Experimental Biology 2018 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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