MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3174078123 · doi:10.1096/fasebj.22.1_supplement.1163.16

Evaluation of whole muscle apoptotic susceptibility in young and old animals

2008· article· en· W3174078123 sur OpenAlexaff
Lawrence Kazak, David A. Hood

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésApoptosisCytosolIn vitroMitochondrionDNA fragmentationFragmentation (computing)BiologyIncubationDNA damagePhosphorylationCell biologyMolecular biologyProgrammed cell deathBiochemistryDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Apoptosis regulates muscle mass during disease and aging. However, the signaling pathways leading to apoptosis need to be established. We developed an in vitro muscle incubation and fractionation protocol to assess the activation and localization of apoptotic proteins in response to various stimuli. Soleus strips (∼10–15mg) from young (6 mo) and old (36 mo) F344XBN rats were used. These strips contain ∼30 fibers/mg weight with <1% fiber damage and they can be incubated in vitro for 4–6 hrs to assess their responsiveness to apoptotic agents. Following incubation, the strips were fractionated into mitochondrial and cytosolic fractions. Subsequently, indices of apoptotic susceptibility were measured. Incubation of muscle strips in vitro with the apoptosis‐inducing agent camptothecin for 4 hours resulted in an increase in mitochondrial Bax in both young and old animals. JNK phosphorylation and DNA fragmentation were elevated by 3‐fold in old, compared to young animals. Bax localization to mitochondria was increased by ∼40% in old animals, and there was a 30% increase in AIF localized to the cytosol. Surprisingly, we detected no differential localization of Cyto c to the cytosol between young and old animals. We conclude that this in vitro muscle strip protocol is useful for the assessment of apoptotic susceptibility in whole muscle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetCell death mechanisms and regulation→Travaux en français237 207→