Mapping and predicting a candidate gene for flesh color in watermelon
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The color of watermelon flesh is an important trait determined by a series of carotenoids. Herein, we used Cream of Saskatchewan (pale yellow flesh) and PI 186490 (white flesh) as parental materials for an F2 segregation and initial mapping using the bulked segregant analysis sequencing (BSA-seq) strategy. The BSA results revealed a flesh color-related QTL that spans approximately 2.45 Mb on chromosome 6. This region was preliminarily positioned in a 382-kb segment, and then narrowed down into a 66.8-kb segment with 1260 F2 individuals. A total of nine candidate genes were in the fine mapping interval, but only Cla007528 (encoding chlorophyllase) had non-synonymous mutations and was significantly expressed between the parental materials throughout flesh development. We also checked the expression patterns of the carotenoid metabolic pathway genes based on RNA-seq data and qRT-PCR validation. Three genes in the xanthophyll cycle (CICHYB, CINCED-1 and CINCED-7) exhibited differential expression patterns between the two parental lines at different flesh color formation stages. ClPSY1, CIPDS, CIZDS, CICHXE, CICRTISO and CILCYB also exhibited clearly different expression patterns accompanied by carotenoid accumulation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle