ATP alters IKK‐2 inhibitor affinity for IKK2 enzyme and reveals non‐equivalent inhibitor binding sites
Notice bibliographique
Résumé
Method Inhibitor off‐rate was measured by two methods: (1) pre‐binding the enzyme with inhibitor followed by measuring the recovery of enzyme activity upon a 200‐fold dilution of the enzyme‐inhibitor complex in the presence of 1mM ATP and (2) measuring the shift in the compound potency (IC50) curves obtained by prebinding the enzyme and inhibitor in the absence of ATP followed by addition of either 1μM or 1mM ATP. Results Three literature inhibitors with potency (IC50) ranging from <1 to 35 nM were used for this study: PHA‐408 (Pfizer), GSK‐082 (GSK), and AVE‐002 (Aventis). The off‐rates (T1/2) measured by the dilution method are 124 and <15 min for PHA‐408 and GSK‐082, respectively. The off‐rate for AVE‐002 was biphasic with half of the enzyme‐inhibitor complex dissociating immediately (T1/2 < 2 min) and the other half bound tightly (T1/2 54 min). The IC50 curves at 1μM and 1mM ATP for PHA‐408 showed no shift using a short 2 min assay and is consistent with the slow off‐rate. GSK‐082 showed a > 10 fold loss of potency with 1mM ATP, as expected for a fast off‐rate inhibitor. AVE‐002 IC50 curve with 1μM ATP was monophasic but displayed a biphasic response with 1mM ATP. Conclusion ATP can change the off‐rate of IKK‐2 inhibitor bound to the enzyme. Additionally, high ATP revealed that AVE‐002 bound in the two inhibitor binding sites of the IKK‐2 homodimer non‐equivalently.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».