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Enregistrement W3174207903 · doi:10.1096/fasebj.20.5.a895

Inhibitors of Class II fructose 1,6‐bisphosphate aldolase

2006· article· en· W3174207903 sur OpenAlexafffundabout
Geneviève Labbé, Sarah de Groot, Timothy Rasmusson, Christine How, Gary I. Dmitrienko, J. Guy Guillemette

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAldolase AAldolase BChemistryFructose-bisphosphate aldolaseStereochemistryBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fructose 1,6‐bisphosphate (FBP) aldolase (E.C. 4.1.2.13 ) catalyzes the reversible aldol condensation of dihydroxyacetonephosphate and glyceraldehyde 3‐phosphate in the Calvin cycle, glycolysis and gluconeogenesis. The FBP aldolases are divided in two groups depending on the reaction mechanism: Class I aldolases form a Schiff‐base intermediate with the substrate and Class II aldolases instead use a divalent metal to stabilize the carbanion intermediate. Since the Class II aldolase is not present in animals or plants, it has been suggested that it could be a viable drug target. In order to develop new specific inhibitors against these enzymes, the Class II FBP aldolases from Mycobacterium tuberculosis , Pseudomonas aeruginosa , Helicobacter pylori , Bacillus cereus and Magnaporthe grisea were cloned into the E. coli expression vector pT7‐7, purified and characterized. All enzymes are dimers except for the M. tuberculosis tetrameric aldolase. The enzymes’ pH curve, temperature and organic solvent stability, and metal utilization were measured. Derivatives of the metal binding agent 2,6‐pyridinedicarboxylic acid, designed to resemble FBP, were synthesized and found to behave as specific mixed inhibitors of the Class II enzyme aldol cleavage reaction. This work was supported by grants from the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada. * Recipient of an Ontario Graduate Scholarship.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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