Inhibitors of Class II fructose 1,6‐bisphosphate aldolase
Notice bibliographique
Résumé
Fructose 1,6‐bisphosphate (FBP) aldolase (E.C. 4.1.2.13 ) catalyzes the reversible aldol condensation of dihydroxyacetonephosphate and glyceraldehyde 3‐phosphate in the Calvin cycle, glycolysis and gluconeogenesis. The FBP aldolases are divided in two groups depending on the reaction mechanism: Class I aldolases form a Schiff‐base intermediate with the substrate and Class II aldolases instead use a divalent metal to stabilize the carbanion intermediate. Since the Class II aldolase is not present in animals or plants, it has been suggested that it could be a viable drug target. In order to develop new specific inhibitors against these enzymes, the Class II FBP aldolases from Mycobacterium tuberculosis , Pseudomonas aeruginosa , Helicobacter pylori , Bacillus cereus and Magnaporthe grisea were cloned into the E. coli expression vector pT7‐7, purified and characterized. All enzymes are dimers except for the M. tuberculosis tetrameric aldolase. The enzymes’ pH curve, temperature and organic solvent stability, and metal utilization were measured. Derivatives of the metal binding agent 2,6‐pyridinedicarboxylic acid, designed to resemble FBP, were synthesized and found to behave as specific mixed inhibitors of the Class II enzyme aldol cleavage reaction. This work was supported by grants from the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada. * Recipient of an Ontario Graduate Scholarship.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».