Genome‐wide screen identifies genes required for Francisella invasion in non‐phagocytic cells
Notice bibliographique
Résumé
The intracellular bacterium Francisella tularensis subspecies tularensis ( F. tularensis ) is the causative agent of tularemia, a disease that can result in 30–35% mortality if left untreated. Due to F. tularensis ' high infectivity and lethality the Centers for Disease Control and Prevention has classified it as a Biosafety Level 3 pathogen and a Category A Select agent. F. tularensis host cell invasion is crucial for their pathogenesis as without invasion disease does not occur. Upon entry into their host, the bacteria colonize both macrophages and epithelial cells. Despite significant research advances in macrophage infections, the study of epithelial infections has lagged behind. To investigate F. tularensis genes involved in epithelial cell invasion, we utilized a biosafety level 2 bacterial surrogate called F. tularensis subspecies novicida ( F. novicida ). A F. novicida transposon mutant library was screened to assess their invasion in hepatocytes. We selected for mutants with reduced intracellular growth using gentamycin‐based invasion/survival assays and confirmed our results microscopically using a subset of mutants. We discovered 232 mutants had significantly reduced invasion/survival levels as compared to wild type F. novicida infections. Ultimately our findings open a new door to the discovery of novel targets for the development of therapeutics and prophylactics. Grant Funding Source : CIHR and NSERC
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».