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Structural Investigation of Melatonin Metabolites as Calmodulin Antagonists and potential Nitric Oxide Synthase Inhibitors

2019· article· en· W3174429671 sur OpenAlexafffundabout
Douglas Pimlott, Guy Guillemette, Thorsten Dieckmann

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCircadian rhythm and melatonin
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésNitric oxide synthaseCalmodulinChemistryNitric oxideGene isoformEnosNOS1Endothelial NOSBiochemistryIn vivoPharmacologyEnzymeBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nitric oxide synthase (NOS) is a flavo‐hemoprotein that catalyzes the conversion of L‐arginine to L‐citrulline in the production nitric oxide (NO). Mammalian NOS exists in three isoforms: endothelial NOS (eNOS), inducible NOS (iNOS) and neuronal NOS (nNOS). Each isoform requires calmodulin (CaM) for activation as CaM binding induces a conformational change, which facilitates electron transfer within the NOS peptide via a highly dynamic process. NO overproduction is implicated in several neurodegenerative and inflammatory conditions including septic shock, epilepsy, myocarditis and Alzheimer's, thus the development of a NOS isoform‐specific inhibitor is of clinical significance. Previous research has shown that N1‐acetyl‐5‐methoxykynuramine (AMK), a metabolite of melatonin (aMT), is a CaM‐dependant inhibitor of nNOS in rat striatum1,2. Despite attenuation of nNOS activity demonstrated both in vitro and in vivo, there has yet to be a comprehensive structural analysis of AMK‐CaM‐NOS complexes. To further validate possible therapeutic applications, we conducted an investigation of AMK interactions with CaM and the CaM‐NOS binding domain for all three NOS isoforms. Our results showed CaM‐AMK binding using gel shift assays, while circular dichroism (CD) results displayed the greatest spectral differences when AMK was added to the CaM‐nNOS complex. This indicates potential isoform‐dependent variation in NOS inhibition due to differences in the CaM‐NOS binding domain. These results were substantiated by subsequent multidimensional NMR experiments, in which the largest differences in chemical shifts occurred when inhibitors were added to the CaM‐nNOS sample, primarily amongst residues found in the N‐lobe of CaM. Our investigation provides significant insight into the potential of AMK as an isoform‐specific NOS inhibitor. Support or Funding Information This work was funded by the NSERC of Canada. This abstract is from the Experimental Biology 2019 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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