Modeling the Development of Cleft Lip and Palate in Variable Clefting Mouse Strains
Notice bibliographique
Résumé
Epigenetic modifications in A‐strain mice can lead to cleft lip and palate (CLP). All A‐strain mice have a retrotransposon present near the Wnt9b gene, yet, two A‐strain mice cleft at very different rates. A/WySn clefts at 25% while A/J clefts at 5%, yet each line isogenic . The difference in clefting rates is thought to be due to changes in methylation of the retrotransposon. This variation in the penetrance of clefting among strains makes this an interesting model for human orofacial clefting as CLP is also variably penetrant in humans. Here, we test the hypothesis that these mice have subtle variations in 3D cell proliferation and apoptosis that cause variation in the shape of the facial tissues during crucial steps of facial formation, leading to CLP. Further, we predict these changes in proliferation, apoptosis and morphology correlate with Wnt9b levels . Genome changes between related A‐strain mice with different CLP levels also suggest that other loci may be involved in the variable clefting present in these mice. Combined, these results imply that variation in gene expression within a genotype leads to variation in cellular dynamics and the resulting morphogenesis, producing CLP leading to cleft development in a subset of A‐strain mice. Support or Funding Information NIH NIDCR R01 DE019638 to RS and BH. CIHR Foundation Grant to BH and RS. CIHR Postdoctoral Fellowship to RG. This abstract is from the Experimental Biology 2019 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».