Translation attenuation via 3′ terminal codon usage in bovine <i>csn1s2</i> is responsible for the difference in αs2‐ and β‐casein profile in milk
Notice bibliographique
Résumé
α s2 ‐casein mRNA ( csn1s2 ) is translated at 25% of the efficiency of β‐casein transcripts ( csn2 ); however, the molecular mechanisms governing the difference are unknown. The main objective of this study was to identify molecular mechanisms that explain differential translational regulation between bovine β‐ and α s2 ‐ casein by assessing the role of putative translational regulatory factors in both cellular and cell‐free translation systems. Sequence analysis indicated that the two transcripts share similar primary and secondary structures around the coding region. Deleting and exchanging untranslated regions (UTRs) on the transcripts suggested that the 3′ UTR of csn2 and the 5′ UTR of csn1s2 exert stimulatory effects on translation yet their effectiveness depends on the upstream and downstream sequences with which they are associated. A stronger effect on translational efficiency was found in the coding region of csn1s2 which displays unfavourable codons at the 3′ terminus. Deletion of a 28‐codon fragment from the 3′ terminus of the csn1s2 coding region increased translation to a par with csn2 . We conclude that the last 28 codons of csn1s2 is the main regulatory element that attenuates its expression and is responsible for the different translational expression of β‐ and α s2 ‐ casein mRNA. This research was supported by NSERC Canada.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».