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Enregistrement W3174776325 · doi:10.1002/hon.24_2879

WHOLE GENOME SEQUENCING OF MATCHED PRIMARY AND RELAPSED DLBCL REVEALS DISTINCT EVOLUTIONARY DYNAMICS ASSOCIATED WITH RELAPSE TIMING

2021· article· en· W3174776325 sur OpenAlexaff
Laura K. Hilton, Brett Collinge, Christopher Rushton, Susanna Ben-Neriah, Kostiantyn Dreval, Bruno M. Grande, M Boyle, Barbara Meissner, Graham W. Slack, Pedro Farinha, Jeffrey W. Craig, Alina S. Gerrie, Ciara L. Freeman, Diego Villa, Kerry J. Savage, Laurie H. Sehn, Marco A. Marra, Christian Steidl, Ryan D. Morin, David W. Scott

Notice bibliographique

RevueHematological Oncology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreSimon Fraser UniversitySpinal Cord Injury BC
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBCL6Fluorescence in situ hybridizationChromosomal translocationDiffuse large B-cell lymphomaBiologySomatic evolution in cancerOncologyInternal medicineLymphomaCancer researchBiopsyLiquid biopsyMedicineGeneChromosomeGeneticsCancerB cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DNTM3A (4/10), TP53 (2/10), ASXL1 (1/10) and CBL (1/10).CHIP was associated with age in newly diagnosed DLBCL (p <0.01), but not IPI Score, tumor volume and tumor DNA (ctDNA) level in plasma.Strikingly, previously untreated pts with CHIP had a significant inferior overall (OS) and event-free survival (EFS) (p = 0.048 and p = 0.024 respectively) (Figure 1A) following immunochemotherapy with curative intent.In contrast, no such impact of CHIP was observed in rrDLBCL treated with Axicabtagene Ciloleucel (p = 0.99 and p = 0.35, respectively).CHIP was associated with lower DLBCL response rates: among evaluable pts without CHIP, 98% achieved a complete or partial remission (CR/PR) compared to only 82% in pts with CHIP (p = 0.05).Of note, therapy-related myelosuppression appeared similar in newly diagnosed DLBCL pts with and without CHIP, as we observed no significant difference in transfusion needs or infection rates (Figure 1C,D,E). Conclusions:In this study CHIP mutations were detected in 12.4% of DLBCL pts.While CHIP is associated with lower response rates and inferior survival outcomes after frontline cytotoxic therapy of DLBCL, this affect appears context-specific, since it was not observed in the rrDLBCL pts treated with CART19.Of interest, the mutational CHIP landscape differed between our 2 cohorts, suggesting that cytotoxic therapy shapes CHIP evolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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