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Enregistrement W31748391 · doi:10.1128/jvi.01688-19

Roland Pierik en Wouter Werner, Cosmopolitanism in Context

2011· article· en· W31748391 sur OpenAlexfundno aff
Edwin Nijhof

Notice bibliographique

RevueNetherlands Journal of Legal Philosophy · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueHistorical Geopolitical and Social Dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsGovernment of Canada
Mots-clésCosmopolitanismContext (archaeology)SociologyPolitical sciencePhilosophyHistoryLawArchaeologyPolitics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Little is known about how genetic variations in viruses affect their success as therapeutic agents. The type 3 Dearing strain of <i>Mammalian orthoreovirus</i> (T3D) is undergoing clinical trials as an oncolytic virotherapy. Worldwide, studies on reovirus oncolysis use T3D stocks propagated in different laboratories. Here, we report that genetic diversification among T3D stocks from various sources extensively impacts oncolytic activity. The T3D strain from the Patrick Lee laboratory strain (TD3<sup>PL</sup>) showed significantly stronger oncolytic activities in a murine model of melanoma than the strain from the Terence Dermody laboratory (T3D<sup>TD</sup>). Overall <i>in vitro</i> replication and cytolytic properties of T3D laboratory strains were assessed by measuring virus plaque size on a panel of human and mouse tumor cells, and results were found to correlate with <i>in vivo</i> oncolytic potency in a melanoma model. T3D<sup>PL</sup> produced larger plaques than T3D<sup>TD</sup> and than the T3D strain from the ATCC (T3D<sup>ATCC</sup>) and from the Kevin Coombs laboratory (T3D<sup>KC</sup>). Reassortant and reverse genetics analyses were used to decipher key genes and polymorphisms that govern enhanced plaque size of T3D<sup>PL</sup> Five single amino acid changes in the S4, M1, and L3 genome segments of reovirus were each partially correlated with plaque size and when combined were able to fully account for differences between T3D<sup>PL</sup> and T3D<sup>TD</sup> Moreover, polymorphisms were discovered in T3D<sup>TD</sup> that promoted virus replication and spread in tumors, and a new T3D<sup>PL</sup>/T3D<sup>TD</sup> hybrid was generated with enhanced plaque size compared to that of T3D<sup>PL</sup> Altogether, single amino acid changes acquired during laboratory virus propagation can have a large impact on reovirus therapeutic potency and warrant consideration as possible confounding variables between studies.<b>IMPORTANCE</b> The reovirus serotype 3 Dearing (T3D) strain is in clinical trials for cancer therapy. We find that closely related laboratory strains of T3D exhibit large differences in their abilities to replicate in cancer cells <i>in vitro</i>, which correlates with oncolytic activity in a in a murine model of melanoma. The study reveals that five single amino acid changes among three reovirus genes strongly impact reovirus therapeutic potency. In general, the findings suggest that attention should be given to genomic divergence of virus strains during research and optimization for cancer therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,753
Score d'incertitude au seuil0,474

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
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