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Enregistrement W3174844405 · doi:10.1101/2021.06.22.21259345

Multi-centre post-implementation evaluation of SARS-CoV-2 antigen-based point of care tests used for asymptomatic screening of continuing care healthcare workers

2021· preprint· en· W3174844405 sur OpenAlexafffundabout
Jamil N. Kanji, Dustin Proctor, William Stokes, Byron M. Berenger, James Silvius, Graham Tipples, A. Mark Joffe, Allison A. Venner

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensAlberta Health ServicesCalgary Laboratory ServicesUniversity of CalgaryUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesGovernment of CanadaAlberta Precision Laboratories
Mots-clésAsymptomaticMedicineFalse positive paradoxPoint-of-care testingHealth carePoint of careInternal medicinePopulationVirologyImmunologyEnvironmental healthPathologyStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract OBJECTIVES Frequent screening of SARS-CoV-2 among asymptomatic populations using antigen-based point of care tests (APOCT) is occurring globally with limited clinical performance data. The positive predictive value (PPV) of two APOCT used in the asymptomatic screening of SARS-CoV-2 among healthcare workers (HCW) at continuing care (CC) sites across Alberta, Canada was evaluated. METHODS Between February 22 and May 2, 2021, CC sites implemented SARS-CoV-2 voluntary screening of their asymptomatic HCW. Onsite testing with Abbott Panbio or BD Veritor occurred on a weekly or twice weekly basis. Positive APOCT were confirmed with a real-time reverse-transcriptase polymerase chain reaction (rRT-PCR) reference method. RESULTS A total of 71,847 APOCT (17,689 Veritor and 54,158 Panbio) were performed among 369 CC sites. Eighty-seven (0.12%) APOCT were positive, of which 39 (0.05%) confirmed as true positives using rRT-PCR. Use of the Veritor and Panbio resulted in a 76.6% and 30.0% false positive detection, respectively (p<0.001). This corresponded to a 23.4% and 70.0% PPV for the Veritor and Panbio, respectively. CONCLUSIONS Frequent screening of SARS-CoV-2 among asymptomatic HCW in CC, using APOCT, resulted in a very low detection rate and a high detection of false positives. Careful assessment between the risks vs benefits of APOCT programs in this population needs to be thoroughly considered before implementation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,084
Score d'incertitude au seuil0,168

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,107
Tête enseignante GPT0,412
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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