Polymorphisms in pulmonary innate immune system genes of swine
Notice bibliographique
Résumé
Modern pigs are unusually susceptible to severe infectious pneumonia. We hypothesize that single nucleotide polymorphisms (SNPs) in innate immune system genes impair resistance to infection or promote injurious inflammatory responses in swine. The objective of this study was to characterize SNPs that code for amino acid substitutions in porcine surfactant protein‐A and ‐D (SP‐A, SP‐D), complement component C3d (C3d), and Toll‐like receptor 2 (TLR‐2). For each gene, RT‐PCR products that cover the entire coding region were subjected to single‐strand conformational polymorphism (SSCP) analysis. RT‐PCR was performed on total RNA extracted from the lungs of randomly chosen diseased pigs submitted to the Animal Health Laboratory, University of Guelph, for diagnostic investigation. Pigs were screened for SNPs by comparing silver‐stained banding patterns of digested, single‐stranded RT‐PCR products separated by SSCP gel electrophoresis. Several different banding patterns were observed in digests of SP‐A, SP‐D and TLR‐2, whereas C3d digests appeared uniform. Sequence comparisons of RT‐PCR products representing different banding patterns revealed three coding SNPs in the C‐type lectin domain of SP‐A. The C‐type lectin domain of SP‐A has an important role in binding microbial surface carbohydrates and these results suggest that pigs may differ in their innate ability to recognize and defend against some respiratory pathogens. Supported by OMAF, Ontario Pork, and the Ontario Veterinary College
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».