MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3175185532 · doi:10.1096/fasebj.2018.32.1_supplement.654.3

Activation and auto‐destruction of the ubiquitin ligase Itch

2018· article· en· W3175185532 sur OpenAlexaffabout
Annie Angers, Riham Ayoubi, Guillaume Desrochers

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUbiquitin ligaseNEDD4UbiquitinUbiquitin-Protein LigasesDNA ligaseChemistryCell biologyHEK 293 cellsBiochemistryBiologyReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ubiquitin ligases of the Nedd4 family are maintained inactive by intramolecular interactions (1). We reported that, like Nedd4, the closely related ubiquitin ligase Itch strongly binds to the endosomal protein LITAF through its WW domains, that recognize two PPXY motifs in the N‐terminal half of LITAF. Unlike Nedd4, Itch binding to LITAF brings the ligase to the lysosomal compartments. We thus postulated that LITAF overexpression might bring Itch to the lysosome, where it would access different substrates and target them for degradation (2). Concomitantly, LITAF binding to Itch may increase Itch ligase activity, as other PPXY motif proteins such as NDFIP and LRAD3 (3,4). Here, we set up to determine if Itch ubiquitin ligase activity is indeed up regulated by LITAF binding, and if Itch most common substrate degradation is increased in response to LITAF binding to Itch. We find that Itch, WWP1, WWP2 and Nedd4 all bind to LITAF, and that the four ligases autoubiquitylation is greatly increased upon LITAF binding, albeit to different levels. Both LITAF overexpression and addition of recombinant LITAF to crude cell lisates lead to rapid degradation of Itch, and, to a lesser extent, Nedd4. Itch substrates cJun and Endophilin degradation was also increased. In vitro ubiquitylation assays show that Itch autoubiquitylation is enhanced in the presence of LITAF, but substrate ubiquitylation was not significantly increased. In conclusion, LITAF binding strongly activate Itch autoubiquitylation, as well as that of other ligases of the Nedd4 family. The consequence of this activation is Itch proteasomal degradation, with little effect on its substrates ubiquitylation. LITAF is thus likely to be a negative regulator of Itch in cells where it is strongly expressed. Support or Funding Information Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC) This abstract is from the Experimental Biology 2018 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetUbiquitin and proteasome pathways→Travaux en français237 207→