Replacement of helix 1′ enhances the lipid binding activity of apoE3 N‐terminal domain
Notice bibliographique
Résumé
The N‐terminal domain of human apolipoprotein E3 (apoE3‐NT) harbors residues critical for interaction with members of the low‐density lipoprotein receptor (LDLR) family. While lipid free apoE3‐NT adopts a stable four‐helix bundle conformation, a lipid binding induced conformational adaptation is required for LDLR binding. To investigate the structural basis for this change, the short helix connecting helix 1 and 2 in the four helix bundle was replaced by the β‐turn sequence, ‐NPNG‐. Recombinant helix‐to‐turn (HT) variant apoE3‐NT was produced in E. coli , isolated and characterized. Stability studies revealed an unfolding transition midpoint of 1.9 M guanidine HCl for HT apoE3‐NT. Reconstituted HDL prepared with HT apoE3‐NT binds to the LDLR. HT apoE3‐NT was more effective than wild type apoE3‐NT at inducing a decrease in phospholipid vesicle light scattering intensity. In a competition binding experiment, HT apoE3‐NT preferentially associated with phospholipase C treated LDL. Results indicate that a mutation at one end of the apoE3‐NT four‐helix bundle markedly enhances the lipid binding activity of this protein. In full‐length apoE, increased NT domain lipid binding affinity may alter the ratio of receptor‐active and ‐inactive conformational states and influence lipoprotein‐LDLR interactions. Supported by TRDRP and NIH.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».