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Enregistrement W3175264120

Evaluating the impact reduced FBXO7 expression has on chromosome instability and cellular transformation in colorectal cancer pathogenesis

2021· dissertation· en· W3175264120 sur OpenAlexaboutno aff
Michaela C. L. Palmer

Notice bibliographique

RevueMspace (University of Manitoba) · 2021
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlutathione Transferases and Polymorphisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColorectal cancerPathogenesisGenome instabilityTransformation (genetics)Chromosome instabilityCancer researchCancerBiologyGeneticsMedicineChromosomeImmunologyDNADNA damageGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Colorectal cancer (CRC) is the third most commonly diagnosed and second most lethal cancer in Canada. Therefore, understanding the genes and pathways driving CRC development is crucial to gain mechanistic insight that can be exploited in future therapies and consequently, decrease morbidity and mortality rates. Chromosome instability (CIN), or ongoing changes in chromosome numbers, is a predominant form of genome instability associated with ~85% of CRCs, suggesting it may be a key mechanism driving CRC oncogenesis. Moreover, CIN enables the acquisition of copy number alterations conferring selective growth, proliferation, and survival advantages, therefore CIN is often associated with cellular transformation. Despite these associations, the aberrant genes underlying CIN remain largely unknown. Recent preliminary screens of suspected CIN genes identified FBXO7 as a strong candidate for further study. FBXO7 encodes an F-box protein, a subunit of the SCF complex that normally targets specific protein substrates for proteolytic degradation by the 26S proteasome. Currently, the impact reduced FBXO7 expression has on CIN, cellular transformation and oncogenesis remains unknown. Thus, establishing the effects of diminished FBXO7 expression will shed new light on the underlying mechanisms of CIN. The current study seeks to evaluate the impact diminished FBXO7 expression has in malignant and non-malignant colonic epithelial cell contexts using complementary siRNA and Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)/Cas9 approaches coupled with single-cell quantitative imaging microscopy (QuantIM) to assess changes in CIN-associated phenotypes. In doing so, QuantIM approaches determined that reduced FBXO7 expression induced increases in nuclear areas, micronucleus formation and frequencies of spreads with aberrant chromosome numbers. Collectively, this work identifies FBXO7 as a novel CIN gene with clinical implications that may contribute to CRC pathogenesis. Thus, this study is a first step towards gaining a novel understanding of the molecular origins of CIN and cellular transformation in CRC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,252
Score d'incertitude au seuil0,921

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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