MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3175288849

Comparative analysis of outer membrane vesicles from cationic adapted Escherichia coli isolates reveals unique vesicle membrane morphologies and different antimicrobial susceptibilities when supplemented to unadapted E. coli

2021· article· en· W3175288849 sur OpenAlexaff
Shelby L. Reimer, Daniel R. Beniac, Shannon L. Hiebert, Timothy F. Booth, Patrick Chong, Garrett Westmacott, George G. Zhanel, Denice C. Bay

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBacterial outer membraneAntimicrobialMicrobiologyChemistryEscherichia coliVesicleBiologyBiochemistryMembrane
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cationic antimicrobials (CA) such as the therapeutic antibiotic colistin (COL) and antiseptics cetrimide (CET) and chlorhexidine (CHX) all exert their mechanism of action by disrupting bacterial membranes, leading to cell content leakage and death. Resistance to CAs is rapidly increasing and of the many antimicrobial resistance mechanisms that may contribute, the role of outer membrane vesicle (OMV) formation is least understood. Here, we gradually adapted E. coli BW215113 K-12 to COL, CET, and CHX by prolonged exposure in vitro to determine how each CA impacts OMV formation. We assessed OMVs isolated from each CA-adapted strain by nanoparticle tracking analysis (NTA) and cryo-transmission electron microscopy (cryo-TEM), and compared OMV proteomes using liquid chromatography-mass spectroscopy. The results of NTA analysis showed that all three CA-adapted strains had increased OMV formation as compared to unadapted BW25113 (WT), where CA-adapted OMVs were significantly larger. Cryo-TEM analyses revealed that each strain’s OMVs had distinctive morphological alterations, where CET-OMVs looked similar to unadapted WT OMVs but were encapsulated and aggregated, CHX-OMVs were multilamellar and COL-OMVs were large (4-12X) and tubular as compared to WT OMVs. Proteomic analysis highlighted significant increases in EptC abundance in COL-OMVs and decreased abundance of MlaA in CHX-OMVs. Antimicrobial susceptibility testing of E. coli BW25113 K-12 supplemented with purified CA-adapted OMVs demonstrated that CET-OMVs did not alter CET susceptibility, CHX-OMVs enhanced BW25113 tolerance to CHX exposure by 2-fold, and COL-OMV supplementation to BW25113 increased COL susceptibility by 2-fold compared to unadapted WT OMVs. Hence, CA adaptation by E. coli has significant ramifications on OMV production and morphology, and CA-adapted OMV exposure has significant consequences for bacterial antimicrobial susceptibility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetBacterial Infections and Vaccines→Travaux en français237 207→