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Enregistrement W3175427624 · doi:10.1101/2021.06.29.450403

Simultaneous Binding of the N- and C-terminal Cytoplasmic Domains of Aquaporin 4 to Calmodulin May Contribute to Vesicular Trafficking

2021· preprint· en· W3175427624 sur OpenAlexafffund
Hiroaki Ishida, Hans J. Vogel, Alex C. Conner, Philip Kitchen, Roslyn M. Bill, Justin A. MacDonald

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésIsothermal titration calorimetryCalmodulinBiophysicsBinding siteCytoplasmChemistryC-terminusPlasma protein bindingBinding proteinBinding domainBiochemistryCell biologyBiologyAmino acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Aquaporin 4 (AQP4) is a water transporting, transmembrane channel protein that has important regulatory roles in maintaining cellular water homeostasis. Several other AQP proteins exhibit calmodulin (CaM)-binding properties, and CaM has recently been implicated in the cell surface localization of AQP4 that occurs in response to osmotically-driven changes in cell swelling in the central nervous system. The objective of the present study was to assess the CaM-binding properties of AQP4 in detail. Inspection of AQP4 revealed two putative CaM-binding domains (CBDs) in the cytoplasmic N- and C-terminal regions, respectively. The Ca 2+ -dependent CaM-binding properties of synthetic and recombinant AQP4 CBD peptides were assessed using fluorescence spectroscopy, isothermal titration calorimetry, and two-dimensional 1 H, 15 N-HSQC NMR with 15 N-labeled CaM. The N-terminal CBD peptide of AQP4 predominantly interacted with the N-lobe of CaM with a 1:1 binding ratio and a K d of 3.4 μM. CaM bound two C-terminal AQP4 peptides with interactions observed for both the C- and N-lobes of CaM (K d1 : 3.6 μM, K d2 : 113.6 μM, respectively). A recombinant AQP4 protein domain (rAQP4ct, containing the entire cytosolic C-terminal domain sequence) bound CaM in a 1:1 binding mode with a K d of 6.1 μM. A ternary bridging complex could be generated with the N- and C-lobes of CaM interacting simultaneously with the N- and C-terminal CBD peptides. These data suggest that this unique adapter protein binding mode of CaM and AQP4 may be an important regulatory mechanism for the vesicular trafficking of AQP4.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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