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Enregistrement W3175437888 · doi:10.1096/fasebj.26.1_supplement.664.10

Allergen‐derived proteinases: Isolation, characterization and signaling via proteinase‐activated receptors (PARs)

2012· article· en· W3175437888 sur OpenAlexafffundabout
Danny Polley, Koichiro Mihara, Mahmoud Saifeddine, Bernard Renaux, Harissios Vliagoftis, Scott Boitano, Michael Daines, Morley D. Hollenberg

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFood Allergy and Anaphylaxis Research
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésTrypsinEnzymeAllergenBiochemistryChemistryWestern blotAffinity chromatographyMolecular biologyBiologyImmunologyAllergy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective To identify proteolytic enzymes in insect and mould asthma allergens and assess their ability to signal via the PARs. Methods Allergen‐derived trypsin‐like enzymes known to contribute to lung inflammation were visualized (western blot) with serine proteinase activity‐based probes (ABP). Enzymes were purified using ion‐exchange chromatography and analyzed for their ABP reactivity & substrate‐inhibitor kinetic profiles. Each enzyme was tested for its activation of PAR–dependent calcium signaling in PAR 1 & PAR 2 ‐expressing KNRK cells. ABP‐labeled enzymes were isolated by avidin affinity chromatography and their peptide sequences determined (mass spectrometry). Results Both allergens contained ABP‐labeled proteinases with MWs of 20–26 kDa. Each enzyme had distinct kinetic substrate (Km) and inhibitor (Ki) profiles. The enzymes all caused PAR 2 calcium signaling, and differentially activated PAR 1 . Sequencing revealed that the allergen proteinases were homologous with previously described trypsin‐like enzymes. Conclusions Diverse allergens contain multiple biochemically distinct trypsin‐like proteinases that are able to target PARs 1 and 2. Thus, PARs and their activating allergen proteinases may be attractive therapeutic targets for the treatment of allergen‐induced asthma. Support: Canadian Institutes of Health Research, NIH USA and Lung Association of Alberta & NWT

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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