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Enregistrement W3175438357 · doi:10.1101/2021.06.24.21259294

Differential pre-pandemic IgA reactivity against SARS-CoV-2 and circulating human coronaviruses measured in milk collected in Uganda and the USA

2021· preprint· en· W3175438357 sur OpenAlexfundno aff
Thomas G. Egwang, Tonny Jimmy Owalla, Emmanuel Okurut, Gonzaga Apungia, Alisa Fox, Claire DeCarlo, Rebecca Powell

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Impact on Reproduction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGrand Challenges CanadaIcahn School of Medicine at Mount Sinai
Mots-clésPandemicCoronavirusMiddle East respiratory syndrome coronavirusBetacoronavirusSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)ImmunityVirologyImmunologyAntibodyBiologyMedicineImmune systemInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective Uganda, like other African countries, has registered fewer COVID-19 cases and deaths per capita than non-African countries. The lower numbers of cases and deaths in Uganda might be due to pre-existing cross-immunity induced by zoonotic coronaviruses or circulating common cold human coronaviruses (HCoVs) before the COVID-19 pandemic. In order to test this premise, we compared IgA reactivity to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and HCoVs in breast milk of US and rural Ugandan mothers collected in 2018 before the COVID-19 epidemic. Ugandan and US pre-pandemic breast milk samples were run in duplicate on enzyme-linked immunoadsorbent assay (ELISA) to measure specific IgA antibody reactivity to the spike proteins of SARS-CoV-2, human coronaviruses (HCoV) NL63, OC43, HKU1, and 229E. Pooled plasma from US COVID-19 positive and negative cases were employed as positive and negative controls, respectively. One Ugandan pre-pandemic milk sample had remarkably high reactivity against all HCoVs and SARS-CoV-2 spike proteins. There was higher IgA reactivity against the betacoronavirus HCoV-OC43 in Ugandan pre-pandemic milk samples by comparison with US pre-pandemic milk samples (p = 0.018). By contrast, there was significantly higher IgA reactivity against the alphacoronaviruses HCoV-229E and HCoV-NL63 in US pre-pandemic milk samples by comparison with Ugandan pre-pandemic milk samples (p < 0.0001 and 0.035, respectively). Conclusion Some Ugandan mothers may have robust pre-existing immunity against SARS-CoV-2 due to cross-immunity induced by HCoVs which may be passed on to their infants via breastfeeding. The differential pre-pandemic reactivity of US mothers to HCoV 229E and HCoV NL63 may have contributed to suboptimal antibody responses to SARS-CoV-2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,384
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,093
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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